No mundo são registrados 1,7 bilhões de casos de doença diarreica aguda (DDA) por ano, sendo considerada a segunda maior causa de morte em crianças menores de 5 anos de idade. Após a introdução da vacina contra rotavírus (RVA) em diversos países do mundo e o aprimoramento das técnicas de diagnóstico molecular, outros vírus emergiram como importantes causadores de DDA, como os sapovírus (SaV), sendo frequentemente associados à surtos e casos esporádicos em adultos e crianças. No Brasil, pouco se sabe sobre a ocorrência do SaV e seu impacto em Saúde Pública. O presente estudo teve por objetivo a padronização, implantação e caracterização molecular de SaV em amostras de fezes de pacientes com gastroenterite. Foram selecionadas amostras negativas para RVA, norovírus e adenovírus entéricos, totalizando 3974 amostras coletadas de pacientes de 0 a 91 anos, provenientes das regiões Sudeste, Sul e Centro-Oeste do Brasil. Os ensaios de PCR convencional e rRT-PCR foram padronizados para implantação no diagnóstico laboratorial dos SaV. Os SaV foram detectados em 149 (3,7%) das amostras analisadas: a faixa etária de 0 a 2 anos foi a mais acometida (5,7%). Este foi o primeiro estudo a detectar SaV no estado de SP, com detecção expressiva no ano de 2016 (8,9%).

A variabilidade genotípica dos SaV nas amostras estudadas foi detectada após a análise de sequencia parcial da VP1:

genogrupo GI (GI.1, GI.2, GI.3, GI.6), genogrupo GII (GII.1, GII.2, GII.3, GII.4 GII.5) e genogrupo GIV (GIV.1).