Salmonella spp. produtoras de beta-lactamases geralmente carreiam genes de resistência a outras classes de antimicrobianos, bem como diversos genes de virulência. Os genes bla na maioria das vezes, são mobilizados por elementos móveis (EGM), identificados em cepas clínicas, ambientais e na cadeia produtiva, reduzindo as opções de tratamento e caracterizando um problema de saúde pública e no setor do agronegócio. O objetivo deste trabalho foi identificar os determinantes genéticos de resistência, plasmidiais, virulência e contexto genético em 36 cepas de Salmonella spp. produtoras de beta-lactamases de espectro estendido (ESBL) e do tipo AmpC isoladas de humanos, aves, alimentos e ambiente por meio do sequenciamento de genoma completo (WGS). Foi caracterizado o resistoma, viroloma e plasmidoma das cepas, bem como o contexto genético dos genes blaCTX e blaCMY. A análise comparativa dos plasmídeos foi realizada com sequências plasmidiais homólogas depositadas no GenBank utilizando dados do sequenciamento long-reads. A filogenia dos sorovares representativos foi realizada pelas técnicas de análise de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) e core genome MLST (cgMLST). Foram identificados genes de resistência aos aminoglicosídeos, fluoroquinolonas (gene plasmidial e mutação), sulfonamidas, tetraciclinas, fosfomicina, cloranfenicol, macrolídeos, trimetoprima e aos compostos de amônio quaternário. A tipagem in silico identificou diversos grupos plasmidiais (Inc), com destaque o IncHI2/HI2A (CTX-M-2), IncI1 (CTX-M-8), IncFIB (CTX-M-65), IncFII e IncI1 (CTX-M-55) e IncI1, IncC, ColpVC e IncX (CMY-2). Em relação ao viruloma, foram identificados nas cepas de todas as variantes: agf, lpf¸ misL, shdA-simH, mgtB/C, mig-14, phoP/Q, invA, sifA, sopB, sopE2, sipA, ssaR, sopD, sipD, flgK, flgB e flgL, e as SPI’s (1,2,3,4,5 e 9). De acordo com sequenciamento long-reads de cepas representativas, o plasmídeo carreador de CTX-M-2 é o IncHI2/NT, CTX-M-8 (IncI1/ST113), CTX-M-65 (IncFIB/NT), CTX-M-55 (IncFII/F33:A-:B-) e CMY-2 (IncI1/ST12, S. Heidelberg; IncC/ST2, S. Minnesota). Os plasmídeos apresentaram uma identidade nucleotídica que variou de 66% a 100% com outros plasmídeos distribuídos mundialmente. A análise de SNPs demonstrou alta similaridade das cepas entre si nos sorovares Heidelberg, Muenchen e Minnesota. No geral, a análise do cgMLST demonstrou similaridade com cepas do Reino Unido e Estados Unidos. Os resultados demonstram a necessidade de intensificar a vigilância de cepas carreadoras de blaESBL e blaAmpC multirresistentes e com perfil de virulência amplo, uma vez que estes genes são mobilizados e disseminados por EGMs e estão cada vez mais presentes na clínica, cadeia produtiva e reservatórios ambientais, impactando no tratamento e no setor do agronegócio.