Results: 26

Transcriptome analysis of Cinnamomum longepaniculatum by high-throughput sequencing

Yan, Kuan; Wei, Qin; Feng, Ruizhang; Zhou, Wanhai; Chen, Fang.

Electron. j. biotechnol; 28 (), 2017

Background: Cinnamomum longepaniculatum is an important commercial crop and the main source of volatile terpenoids. The biosynthesis of key bioactive metabolites of C. longepaniculatum is not well understood because of the lack of available genomic and transcriptomic information. To address this issue, w...

Cinnamomum/genética, Repeticiones de Microsatélite, Terpenos/metabolismo, Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento, Aceites Volátiles/metabolismo, Transcripción Genética, Cruzamiento, Transcriptoma, Ontología de Genes, Anotación de Secuencia Molecular

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Analysis of gene expression changes associated with human carcinoma-associated fibroblasts in non-small cell lung carcinoma

Wu, Xiaofen; Ruan, Lei; Yang, Yi; Mei, Qi.

Biol. Res; 50 (), 2017

BACKGROUND: This study aimed to investigate the gene expression changes associated with carcinoma-associated fibroblasts (CAFs) involving in non-small cell lung carcinoma (NSCLC). METHODS: We downloaded the GEO series GSE22862, which contained matched gene expression values for 15 CAF and normal fibrobla...

Fibroblastos Asociados al Cáncer, Carcinoma/genética, Carcinoma de Pulmón de Células no Pequeñas/genética, Regulación Neoplásica de la Expresión Génica, Neoplasias Pulmonares/genética, Carcinoma/patología, Carcinoma de Pulmón de Células no Pequeñas/patología, Neoplasias Pulmonares/patología, Factor de Crecimiento Transformador beta/genética, Alelos, Regulación hacia Abajo, Dosificación de Gen, Perfilación de la Expresión Génica, Ontología de Genes, Estudios de Asociación Genética, Pérdida de Heterocigocidad, Mapas de Interacción de Proteínas, Análisis de Matrices Tisulares, Regulación hacia Arriba

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De novo transcriptome assembly, functional annotation and differential gene expression analysis of juvenile and adult E. fetida, a model oligochaete used in ecotoxicological studies

Thunders, Michelle; Cavanagh, Jo; Li, Yinsheng.

Biol. Res; 50 (), 2017

BACKGROUND: Earthworms are sensitive to toxic chemicals present in the soil and so are useful indicator organisms for soil health. Eisenia fetida are commonly used in ecotoxicological studies; therefore the assembly of a baseline transcriptome is important for subsequent analyses exploring the impact of ...

Ecotoxicología, Perfilación de la Expresión Génica/métodos, Oligoquetos/genética, Transcriptoma, Oligoquetos/efectos de los fármacos, Análisis de Secuencia de ARN/métodos, Contaminantes del Suelo/toxicidad, Toxicogenética/métodos, Exposición a Riesgos Ambientales, Ontología de Genes, Programas Informáticos

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Estendendo o domínio da Ontocancro 3. 0 para abordar o Inflammaging

Extending the field of Ontocancro 3. 0 to approach the Inflammaging

Bonini, Jéssica Augusti; Stringhini, Rômulo M; Facalde, Laís; Librelotto, Giovani R.

J. health inform; 8 (supl.I), 2016

Esse trabalho tem o objetivo de integrar os dados das versões anteriores da Ontocancro, projeto que visa o desenvolvimento de estudos na área da genética, e as especificações do termo Inflammaging, o qual é definido pelo estado inflamatório crônico devido ao envelhecimento. A Ontocancro 3.0 possi...

Ontología de Genes, Biología Computacional, Bases de Datos Genéticas, Congresos como Asunto

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Transcriptome responses to heat- and cold-stress in ladybirds (Cryptolaemus montrouzieri Mulasnt) analyzed by deep-sequencing

Zhang, Yuhong; Wu, Hongsheng; Xie, Jiaqin; Jiang, Ruixin; Deng, Congshuang; Pang, Hong.

Biol. Res; 48 (), 2015

BACKGROUND: Changed temperature not only threaten agricultural production, but they also affect individual biological behavior, population and community of many insects, and consequently reduce the stability of our ecosystem. Insect's ability to respond to temperature stress evolved through a complex ada...

Respuesta al Choque por Frío/genética, Escarabajos/genética, Respuesta al Choque Térmico/genética, Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento/métodos, Transcriptoma, Escarabajos/clasificación, Escarabajos/enzimología, Perfilación de la Expresión Génica/métodos, Genes de Insecto/fisiología, Análisis de Secuencia de ADN/métodos, Estrés Fisiológico/genética, Frío, Cartilla de ADN, Biblioteca de Genes, Ontología de Genes, Calor, Reacción en Cadena en Tiempo Real de la Polimerasa

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Analysis of gene expression profiles in response to Sporisorium reilianum f. sp. zeae in maize (Zea mays L.)

Yu, Tao; Wang, Zhenhua; Jin, Xiaochun; Liu, Xianjun; Kan, Shuaishuai.

Electron. j. biotechnol; 17 (5), 2014

Background Head smut of maize, which is caused by Sporisorium reilianum f. sp. zeae (Kühn), is a serious disease in maize. In order to reveal the molecular mechanism of the resistance to head smut in maize, a microarray containing ~ 14,850 probes was used to monitor the gene expression profiles between ...

Enfermedades de las Plantas/genética, Resistencia a la Enfermedad/genética, Zea mays/genética, Expresión Génica, ARN/aislamiento & purificación, Hibridación de Ácido Nucleico, Análisis por Micromatrices, Reacción en Cadena en Tiempo Real de la Polimerasa, Ontología de Genes

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