Background: Helicobacter pylori is the most significant pathogen associated with gastric diseases, including gastric cancer. Infected patients with strains that are CagA-positive generally have worse outcomes than those infected with CagA-negative strains. Patients infected with CagA-positive strains hav...
Antígenos Bacterianos/genética,
Proteínas Bacterianas/genética,
ADN Bacteriano/genética,
Heces/microbiología,
Infecciones por Helicobacter/diagnóstico,
Helicobacter pylori/genética,
Gastropatías/microbiología,
Antígenos Bacterianos/aislamiento & purificación,
Endoscopía del Sistema Digestivo,
Reacción en Cadena de la Polimerasa,
Sensibilidad y Especificidad,
Gastropatías/diagnóstico,
Proteínas Bacterianas/aislamiento & purificación
Resumen Introducción: La resistencia de enterobacterias a quinolonas se ha difundido por el mundo, fenómeno presente también en Venezuela. El mecanismo de esta resistencia pudiera estar mediado por genes incluidos en el cromosoma bacteriano o transmitirse en el interior de plásmidos. Objetivo: Eval...
Antibacterianos/farmacología,
Farmacorresistencia Bacteriana/genética,
Enterobacteriaceae/genética,
Infecciones por Enterobacteriaceae/genética,
Bacterias Gramnegativas/genética,
Plásmidos,
Quinolonas/farmacología,
Resistencia betalactámica/genética,
ADN Bacteriano/genética,
Enterobacteriaceae/aislamiento & purificación,
Infecciones por Enterobacteriaceae/microbiología,
Proteínas de Escherichia coli,
Genes Bacterianos,
Bacterias Gramnegativas/clasificación,
Hospitales Universitarios,
Pruebas de Sensibilidad Microbiana,
Reacción en Cadena de la Polimerasa,
Análisis de Secuencia de ADN,
Venezuela,
beta-Lactamasas/genética
ABSTRACT In this report, we present a draft genome of 2,886,173 bp of an Exiguobacterium aurantiacum strain PN47 isolate from the sediment of a saline pond named "Salar del Huasco" in the Altiplano in the North of Chile. Strain PN47 encodes adaptive characteristics enabling survival in extreme environmen...
Bacillaceae/clasificación,
Bacillaceae/genética,
Bacillaceae/aislamiento & purificación,
Bacillaceae/metabolismo,
Secuencia de Bases,
Chile,
ADN Bacteriano/genética,
Genoma Bacteriano,
Metales Pesados/análisis,
Metales Pesados/metabolismo,
Filogenia,
Estanques/química,
Estanques/microbiología,
Cloruro de Sodio/análisis,
Cloruro de Sodio/metabolismo
ABSTRACT As the largest genus in Actinobacteria family, Streptomyces species have the ability to synthesize numerous compounds of diverse structures with bioactivities. Streptomyces mangrovisoli MUSC 149T was previously isolated as a novel streptomycete from mangrove forest in east coast of Peninsular Ma...
Proteínas Bacterianas/genética,
Proteínas Bacterianas/metabolismo,
Composición de Base,
Secuencia de Bases,
ADN Bacteriano/genética,
Genoma Bacteriano,
Sedimentos Geológicos/microbiología,
Malasia,
Datos de Secuencia Molecular,
Filogenia,
Streptomyces/clasificación,
Streptomyces/genética,
Streptomyces/aislamiento & purificación
ABSTRACT The type strain SUR2 of the novel species Chryseobacterium limigenitum was isolated from a dehydrated sludge of the municipal sewage treatment plant in Dogoše near Maribor in Slovenia. The draft genome, with 60 contigs, 4,697,725 bp, 34.4% of G+C content, was obtained using the Illumina HiS...
Antibacterianos/farmacología,
Composición de Base,
Secuencia de Bases,
Carbapenémicos/farmacología,
Chryseobacterium/clasificación,
Chryseobacterium/efectos de los fármacos,
Chryseobacterium/genética,
Chryseobacterium/aislamiento & purificación,
ADN Bacteriano/genética,
Genoma Bacteriano,
Pruebas de Sensibilidad Microbiana,
Datos de Secuencia Molecular,
Penicilinas/farmacología,
Filogenia,
Aguas del Alcantarillado/química,
Aguas del Alcantarillado/microbiología
ABSTRACT Vitellibacter aquimaris D-24T (=KCTC 42708T = DSM 101732T), a halophilic marine bacterium, was isolated from seawater collected from Desaru beach, Malaysia. Here, we present the draft genome sequence of D-24T with a genome size of approximately 3.1 Mbp and G + C content of 39.93%. The genome of ...
Composición de Base,
Secuencia de Bases,
ADN Bacteriano/genética,
Flavobacteriaceae/clasificación,
Flavobacteriaceae/genética,
Flavobacteriaceae/aislamiento & purificación,
Genoma Bacteriano,
Malasia,
Datos de Secuencia Molecular,
Filogenia,
Agua de Mar/microbiología
ABSTRACT Bacillus anthracis strain SPV842_15 was isolated from bovine fetus, while B. anthracis strain Brazilian vaccinal was recovered from a commercial vaccine. We report here the genome sequences of both strains. The SPV842_15 genome is composed of a single circular chromosome with a length of 5,228,6...
Bacillus anthracis/clasificación,
Bacillus anthracis/genética,
Bacillus anthracis/aislamiento & purificación,
Vacunas Bacterianas/genética,
Vacunas Bacterianas/aislamiento & purificación,
Composición de Base,
Secuencia de Bases,
Enfermedades de los Bovinos/microbiología,
ADN Bacteriano/genética,
Genoma Bacteriano,
Datos de Secuencia Molecular,
Filogenia,
Plásmidos/genética
ABSTRACT We developed a loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay for the detection of Y. pestis by targeting the 3a sequence on chromosome. All 11 species of the genus Yersinia were used to evaluate the specificity of LAMP and PCR, demonstrating that the primers had a high level of specificity...
Cartilla de ADN/genética,
ADN Bacteriano/química,
ADN Bacteriano/genética,
ADN Bacteriano/aislamiento & purificación,
Separación Inmunomagnética,
Magnetismo/instrumentación,
Magnetismo/métodos,
Técnicas de Amplificación de Ácido Nucleico/instrumentación,
Técnicas de Amplificación de Ácido Nucleico/métodos,
Peste/microbiología,
Reacción en Cadena de la Polimerasa,
Sensibilidad y Especificidad,
Yersinia pestis/clasificación,
Yersinia pestis/genética,
Yersinia pestis/aislamiento & purificación
ABSTRACT Kosakonia cowanii type strain 888-76T is a human pathogen which was originally isolated from blood as NIH group 42. In this study, we report the complete genome sequence of K. cowanii 888-76T. 888-76T has 1 chromosome and 2 plasmids with a total genome size of 4,857,567 bp and C+G 56.15%. This g...
Composición de Base,
Secuencia de Bases,
ADN Bacteriano/genética,
Enterobacteriaceae/clasificación,
Enterobacteriaceae/genética,
Enterobacteriaceae/aislamiento & purificación,
Infecciones por Enterobacteriaceae/microbiología,
Genoma Bacteriano,
Datos de Secuencia Molecular,
Filogenia,
Plásmidos/genética
ABSTRACT Introduction: Staphylococcus spp. - both S. aureus, including methicillin-resistant strains (MRSA) and coagulase negative staphylococci (CoNS) - are relevant agents of healthcare-associated infections. Therefore, the rapid recognition of MRSA and methicillin-resistant CoNS from blood stream inf...
Antibacterianos/farmacología,
Bacteriemia/diagnóstico,
Bacteriemia/microbiología,
Proteínas Bacterianas/genética,
Proteínas Bacterianas/aislamiento & purificación,
Sangre/microbiología,
Cultivo de Sangre,
ADN Bacteriano/genética,
Staphylococcus aureus Resistente a Meticilina/genética,
Reacción en Cadena de la Polimerasa Multiplex,
Oxacilina/farmacología,
Proteínas de Unión a las Penicilinas/genética,
Proteínas de Unión a las Penicilinas/aislamiento & purificación,
Infecciones Estafilocócicas/diagnóstico,
Staphylococcus aureus/efectos de los fármacos,
Staphylococcus aureus/aislamiento & purificación
