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Detección y cuantificación de SARS-CoV-2 en plantas de tratamiento de aguas residuales de diferentes ciudades de Chile: hacia la implementación de una vigilancia centinela permanente

Olivares-Pacheco, Jorge; Adell, Aiko D; Hepp, Matías I; Reis, Andressa S; Echeverría, César; Ibacache-Quiroga, Claudia; Assmann, Paulina; Gaggero, Aldo.
Rev. chil. infectol; 39 (6), 2022
INTRODUCCIÓN: La cuantificación de SARS-CoV-2 en aguas residuales es una herramienta que permite determinar la tendencia de la circulación viral en un área geográfica determinada. OBJETIVO: Cuantificar el virus SARS-CoV-2 en 15 plantas de tratamiento de aguas residuales en diferentes ciudades de Chi...
COVID-19/epidemiología, Aguas Residuales/virología, SARS-CoV-2/aislamiento & purificación, Monitoreo Epidemiológico Basado en Aguas Residuales, Carga Viral, Chile/epidemiología, SARS-CoV-2/genética, Reacción en Cadena en Tiempo Real de la Polimerasa/métodos, ARN Viral/genética, Genómica
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SARS-CoV-2 nucleic acid shedding is variable for every person

Lima-Morales, Daiana de; Wink, Priscila Lamb; Volpato, Fabiana Caroline Zempulski; Camargo, Joíza Lins; de-Paris, Fernanda; Barth, Afonso Luís.
Rev. Soc. Bras. Med. Trop; 54 (), 2021
Abstract INTRODUCTION: Considering the persistent positivity on RT-qPCR tests, the results of SARS-CoV-2 were monitored to evaluate the viral RNA shedding period. METHODS: Between March and June 2020, the sequential results of 29 healthcare workers' were monitored using RT-qPCR. RESULTS: More than 50%...
COVID-19, Ácidos Nucleicos, ARN Viral/genética, Reacción en Cadena en Tiempo Real de la Polimerasa, SARS-CoV-2, Esparcimiento de Virus
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Coronavirus persistence in human respiratory tract and cell culture: An overview

Gaspar-Rodríguez, Adriana; Padilla-González, Ana; Rivera-Toledo, Evelyn.
Braz. j. infect. dis; 25 (5), 2021
ABSTRACT Emerging human coronaviruses, including the recently identified SARS-CoV-2, are relevant respiratory pathogens due to their potential to cause epidemics with high case fatality rates, although endemic coronaviruses are also important for immunocompromised patients. Long-term coronavirus infectio...
COVID-19, Técnicas de Cultivo de Célula, ARN Viral/genética, Sistema Respiratorio, SARS-CoV-2
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El testeo inicial de los pacientes con infección por COVID-19 tiene una alta tasa de resultados falsamente negativos
Initial testing of patients with COVID-19 infection has a high rate of false negative results

Pagotto, Vanina.
Evid. actual. práct. ambul; 24 (1), 2021
ARN Viral/aislamiento & purificación, ARN Viral/genética, Betacoronavirus/aislamiento & purificación, Betacoronavirus/genética, Infecciones por Coronavirus/diagnóstico, Infecciones por Coronavirus/virología, Reacciones Falso Negativas, Revisiones Sistemáticas como Asunto
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Immunity, virus evolution, and effectiveness of SARS-CoV-2 vaccines

Belizário, J E.
Braz. j. med. biol. res; 54 (5), 2021
Phylogenetic and pathogenesis studies of the severe acute respiratory syndrome-related coronaviruses (SARS-CoVs) strains have highlighted some specific mutations that could confer the RNA genome fitness advantages and immunological resistance for their rapid spread in the human population. The analyses o...
Vacunas contra la COVID-19, COVID-19, Filogenia, ARN Viral/genética, SARS-CoV-2
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Variabilidad genética y epigenética, y la pandemia de Covid-19

Rivera-Silva, Gerardo.
Salud pública Méx; 62 (5), 2020
Betacoronavirus/genética, Infecciones por Coronavirus/genética, Epigénesis Genética, Pandemias, Neumonía Viral/genética, Enzima Convertidora de Angiotensina 2, COVID-19, Infecciones por Coronavirus/epidemiología, Resistencia a la Enfermedad/genética, Predisposición Genética a la Enfermedad/genética, Variación Genética, Genoma Humano, Genoma Viral, Genotipo, Antígenos HLA-B/genética, Haplotipos, Peptidil-Dipeptidasa A/genética, Neumonía Viral/epidemiología, ARN Viral/genética, Receptores Virales/genética, SARS-CoV-2
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Differential replicative fitness of the four dengue virus serotypes circulating in Colombia in human liver Huh7 cells

Gutiérrez-Barbosa, Hernando; Castañeda, Nadia Y; Castellanos, Jaime E.
Braz. j. infect. dis; 24 (1), 2020
ABSTRACT Dengue has been a significant public health problem in Colombia since the simultaneous circulation of the four dengue virus serotypes. The replicative fitness of dengue is a biological feature important for virus evolution and contributes to elucidating the behavior of virus populations and vira...
Línea Celular, Supervivencia Celular, Células Cultivadas, Colombia, Virus del Dengue/genética, Virus del Dengue/patogenicidad, Citometría de Flujo, Formazáns, Hígado/citología, ARN Viral/genética, Valores de Referencia, Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa, Serogrupo, Sales de Tetrazolio, Factores de Tiempo, Ensayo de Placa Viral, Replicación Viral/genética
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Zika virus RNA excretion in sweat with concomitant detection in other body fluid specimens

Menezes-Neto, Armando; Castilho, Marcia da Costa; Calvet, Guilherme Amaral; Kara, Edna Oliveira; Bôtto-Menezes, Camila Helena Aguiar; Lacerda, Marcus Vinícius Guimarães; Pereira, Gerson Fernando Mendes; Giozza, Silvana Pereira; Bermudez, Ximena Pamela Diaz; Lima, Noemia Santana; Modjarrad, Kayvon; Broutet, Nathalie; de Filippis, Ana Maria Bispo; Franca, Rafael Freitas Oliveira.
Mem. Inst. Oswaldo Cruz; 115 (), 2020
We evaluated sweat, blood and urine specimens obtained from an ongoing cohort study in Brazil. Samples were collected at pre-established intervals after the initial rash presentation and tested for Zika virus (ZIKV) RNA presence by real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction (rRT-PCR). From...
Sangre/virología, Brasil/epidemiología, Estudios de Cohortes, ARN Viral/clasificación, ARN Viral/genética, ARN Viral/aislamiento & purificación, Reacción en Cadena en Tiempo Real de la Polimerasa, Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa, Sudor/virología, Orina/virología, Virus Zika/genética, Virus Zika/aislamiento & purificación, Infección por el Virus Zika/diagnóstico, Infección por el Virus Zika/epidemiología
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Genomic detection of a virus lineage replacement event of dengue virus serotype 2 in Brazil, 2019

de Jesus, Jaqueline Goes; Dutra, Karina Rocha; Sales, Flavia Cristina da Silva; Claro, Ingra Morales; Terzian, Ana Carolina; Candido, Darlan da Silva; Hill, Sarah C; Thézé, Julien; Torres, Celeste; DAgostini, Tatiana Lang; Felix, Alvina Clara; Reis, Andreia F Negri; Alcantara, Luiz Carlos Junior; de Abreu, André L; Croda, Júlio HR; de Oliveira, Wanderson K; de Filipis, Ana Maria Bispo; Camis, Maria do Carmo Rodrigues dos Santos; Romano, Camila Malta; Loman, Nick J; Pybus, Oliver G; Sabino, Ester Cerdeira; Nogueira, Mauricio L; Faria, Nuno Rodrigues.
Mem. Inst. Oswaldo Cruz; 115 (), 2020
BACKGROUND Despite efforts to mitigate the impact of dengue virus (DENV) epidemics, the virus remains a public health problem in tropical and subtropical regions around the world. Most DENV cases in the Americas between January and July 2019 were reported in Brazil. São Paulo State in the southeast of ...
Brasil, Dengue/virología, Virus del Dengue/genética, Variación Genética, Genómica, Genotipo, Filogenia, ARN Viral/genética
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In silico analysis of mismatches in RT-qPCR assays of 177 SARS-CoV-2 sequences from Brazil

Santos, Renan da Silva; Bret, Raissa Souza Caminha; Moreira, Ana Cristina de Oliveira Monteiro; Campos, Adriana Rolim; Silva, Angelo Roncalli Alves e; Lima, Danielle Malta; Tavares, Kaio Cesar Simiano.
Rev. Soc. Bras. Med. Trop; 53 (), 2020
Abstract INTRODUCTION: Quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (RT-qPCR) can detect the severe acute respiratory syndrome Coronavirus-2 (SARS-CoV-2) in a highly specific manner. However, a decrease in the specificity of PCR assays for their targets may lead to false negative result...
Brasil, Infecciones por Coronavirus/virología, Simulación por Computador, Genoma Viral, Pandemias, ARN Viral/genética, Reacción en Cadena de la Polimerasa de Transcriptasa Inversa, Betacoronavirus/genética, Sensibilidad y Especificidad
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