BACKGROUND: Scavenger receptor class B (SRB) is a multifunctional protein in animals that participates in physiological processes, including recognition of a wide range of ligands. Astaxanthin is a major carotenoid found in shrimp. However, the molecular mechanism of astaxanthin and SRB protein binding h...
Receptores Depuradores/genética,
Receptores Depuradores/metabolismo,
Penaeidae,
Receptores Depuradores/aislamiento & purificación,
Cromatografía Líquida de Alta Presión,
Xantófilas,
Transcriptoma,
Western Blotting,
Técnicas In Vitro,
Reacción en Cadena en Tiempo Real de la Polimerasa/métodos,
Alineación de Secuencia
Hao, Kaiqiang;
Lin, Beisen;
Nian, Fuzhao;
Gao, Xi;
Wei, Zhong;
Luo, Gang;
Lu, Yachun;
Lan, Mingxian;
Yang, Jinguang;
Wu, Guoxing.
Phytophthora parasitica is an important oomycete that causes disease in a variety of plants, dimethomorph fungicides being specific for oomycetes. The aim of this study was to use RNA-seq to rapidly discover the mechanism by which dimethomorph acts in the treatment of P. parasitica. We found that the exp...
Fungicidas Industriales/farmacología,
Morfolinas/farmacología,
Phytophthora/efectos de los fármacos,
ARN Mensajero/biosíntesis,
RNA-Seq,
Proteínas Portadoras/biosíntesis,
Proteínas Portadoras/genética,
Permeabilidad de la Membrana Celular/efectos de los fármacos,
Permeabilidad de la Membrana Celular/genética,
Pared Celular/metabolismo,
Regulación de la Expresión Génica/efectos de los fármacos,
Ontología de Genes,
Estrés Oxidativo/genética,
Phytophthora/genética,
Enfermedades de las Plantas/parasitología,
ARN Mensajero/genética,
Especies Reactivas de Oxígeno,
Reacción en Cadena en Tiempo Real de la Polimerasa,
Alineación de Secuencia,
beta-Glucanos/análisis
Resumen Introducción. Los departamentos de Chocó y Antioquia en Colombia presentan condiciones climáticas y de vegetación que favorecen el establecimiento de especies de vectores del género Lutzomyia y la transmisión de Leishmania spp. a poblaciones humanas que ingresan a ambientes selváticos co...
Insectos Vectores,
Psychodidae,
Distribución Animal,
Secuencia de Bases,
Colombia/epidemiología,
Ecología,
Complejo IV de Transporte de Electrones/genética,
Bosques,
Proteínas de Insectos/genética,
Insectos Vectores/clasificación,
Insectos Vectores/genética,
Leishmaniasis Cutánea/epidemiología,
Leishmaniasis Cutánea/transmisión,
Parques Recreativos,
Filogenia,
Psychodidae/clasificación,
Psychodidae/genética,
Alineación de Secuencia,
Homología de Secuencia de Ácido Nucleico,
Especificidad de la Especie
The current yellow fever outbreak in Brazil is the most severe one in the country in recent times. It has rapidly spread to areas where YF virus (YFV) activity has not been observed for more than 70 years and vaccine coverage is almost null. Here, we sequenced the whole YFV genome of two naturally infect...
Alouatta/virología,
Secuencia de Aminoácidos,
Brasil/epidemiología,
Brotes de Enfermedades,
Genoma Viral/genética,
Genotipo,
Enfermedades de los Monos/epidemiología,
Enfermedades de los Monos/virología,
Filogenia,
Polimorfismo Genético/genética,
Alineación de Secuencia,
Fiebre Amarilla/epidemiología,
Fiebre Amarilla/veterinaria,
Fiebre Amarilla/virología,
Virus de la Fiebre Amarilla/genética
Introdução. A leishmaniose tegumentar americana (LTA) é uma endemia de importância em saúde pública na Amazônia Brasileira, onde possui diferentes perfis de transmissão com a participação de diversas espécies de vetores e de protozoários do gênero Leishmania. O Estado do Acre apresenta altos...
Leishmaniasis Cutánea/epidemiología,
Transmisión de Enfermedad Infecciosa,
Biodiversidad,
Vectores de Enfermedades,
Psychodidae,
Animales Salvajes,
Leishmania,
Hevea,
28441,
Distribución de Chi-Cuadrado,
Alineación de Secuencia
Abstract Metabolites of mycoparasitic fungal species such as Trichoderma harzianum 88 have important biological roles. In this study, two new ketoacyl synthase (KS) fragments were isolated from cultured Trichoderma harzianum 88 mycelia using degenerate primers and analysed using a phylogenetic tree. The ...
Proteínas Fúngicas/metabolismo,
Sintasas Poliquetidas/metabolismo,
Trichoderma/enzimología,
Secuencia de Aminoácidos,
Proteínas Fúngicas/química,
Proteínas Fúngicas/genética,
Regulación Fúngica de la Expresión Génica,
Datos de Secuencia Molecular,
Micelio/enzimología,
Micelio/genética,
Enfermedades de las Plantas/microbiología,
Sintasas Poliquetidas/química,
Sintasas Poliquetidas/genética,
Alineación de Secuencia,
Trichoderma/clasificación,
Trichoderma/genética
Aslam, Naeem;
Nadeem, Asif;
Babar, Masroor Ellahi;
Pervez, Muhammad Tariq;
Aslam, Muhammad;
Naveed, Nasir;
Hussain, Tanveer;
Shehzad, Wasim;
Wasim, Muhammad;
Bao, Zhang;
Javed, Maryam.
Background: Protein structural alignment is one of the most fundamental and crucial areas of research in the domain of computational structural biology. Comparison of a protein structure with known structures helps to classify it as a new or belonging to a known group of proteins. This, in turn, is usefu...
Background: Discovering biomarkers is a fundamental step to understand and deal with genetic diseases. Methods using classic Computer Science algorithms have been adapted in order to support processing large biological data sets, aiming to find useful information to understand causing conditions of disea...
Background: Cyclophilin A (CypA), a receptor for the immunosuppressive agent cyclosporin A (CsA), is a cis-trans peptidyl-prolyl isomerase (PPIase) which accelerates the cis-trans isomerization of prolyl-peptide bonds and interacts with a variety of proteins to regulate their activities. Results: The ful...
