Este estudo tem como objetivo descrever as particularidades teórico-metodológicas e discutir as experiências vivenciadas no processo de pesquisa sobre fragilidade biológica e condições de saúde de idosos ribeirinhos amazônicos. A pesquisa descritiva, de abordagem qualiquantitativa, realizada em 19 ilhas do município de Cametá, Pará, envolveu 108 idosos e permitiu alcançar tanto as proposições diretas sobre os marcadores de fragilidade e de saúde multidimensional, quanto os aspectos subjetivos referentes às particularidades do contexto histórico-cultural. A trajetória percorrida pelos pesquisadores nesse desafio foi marcada, especialmente, por uma arreigada estruturação metodológica, direcionada ao contexto peculiar da pesquisa, desde a inserção ecológica dos pesquisadores, ponto-chave para a concretização do arcabouço metodológico e do período de coleta de dados até a elaboração das propostas norteadoras em saúde pública considerando, sobretudo, as particularidades dos modelos de cuidado vigentes nessas comunidades amazônicas.