El objetivo del estudio fue describir las prevalencias de bajo peso al nacer a término y las desigualdades socio-geográficas entre los municipios y regiones de Colombia. Se realizó un estudio ecológico longitudinal a partir de los registros de estadísticas vitales del Departamento Administrativo Nacional de Estadística (DANE) de 1096 municipios de Colombia entre los años 2000 y 2014. La población de estudio fueron 7.514.492 nacidos vivos a término, de partos de único feto de madres entre 15 a 45 años. Se ajustó un modelo jerárquico bayesiano para la estimación de riesgos relativos suavizados y sus intervalos de credibilidad (95%). Como resultados se encontró que la prevalencia de bajo peso al nacer en Colombia fue de 2,28 (2,26-2,29), con una tendencia a la reducción pasando de 2,80 en el 2000 a 1.79 en el 2014. Se observaron desigualdades territoriales, en donde los municipios más pobres y menos desarrollados mostraron mayores riesgos de bajo peso al nacer a término, tendencia que se mantuvo a lo largo del periodo analizado. En conclusión, existe una tendencia a la disminución de bajo peso al nacer a término en Colombia, para cada una de sus regiones y un gradiente social negativo.