La alta varialbilidad de la fiebre aftosa, debida entre otros factores a la recombinacion genetica y a la presion selectiva de los anticuerpos en areas con vacunacion sistematica, hace que una cepa de virus ocasione una unica onda epidemica. Por lo tanto, la lista de subtipos debe ser actualizadaperiodicamente para eliminar los que no actuan mas en el campo. Los laboratorios de diagnostico han de apoyar a las campanas de control de la enfermedad relacionando antigenica e inmunogenicamente las cepas de campo con las usadas en la produccion de la vacuna. La cobertura de las cepas vacunales, ademas, es de suma utilidad e interes para los bancos de vacunas. Una prueba recomendable para este tipo de estudio es la seroproteccion realizada con sueros de bovinos vacunados y revacunados. Una EPP inferior al 75% en sueros de bovinos revacunados es indicacion de baja proteccion en el campo.