Estudo exploratório, com abordagem qualitativa, cujo objetivo foi identificar os saberes instrumentais e ideológicos presentes nos processos de trabalho de enfermeiros denúcleos hospitalares de epidemiologia. Desenvolvido junto a nove enfermeiros que atuam em Núcleo Hospitalar de Epidemiologia de cinco instituições hospitalares da cidade de Curitiba/PR. Para coleta dos dados, realizada entre março e maio de 2012, utilizou-se roteiro de entrevista aberta, analisados pela análise do discurso. Constatou-se centralidade dos discursos dos enfermeiros nos saberes instrumentais inerentes ao processo de trabalho em vigilância epidemiológica hospitalar e foi evidenciada influência significativa dos saberes instrumentais no cotidiano das ações dos enfermeiros, que buscam espaço de atuação e autonomia nas instituições para consolidação da vigilância epidemiológica hospitalar, mas necessitam de maior reflexão acerca das políticas públicas e de seu processo de trabalho. Acredita-se que este estudo possibilitará a construção de novos caminhos para a atuação dos enfermeiros dos núcleos hospitalares, menos centrados em tarefas, mas na interpretação crítica e na proposição de políticas públicas condizentes com as necessidades de saúde da população e capazes de integrar os diferentes níveis de atenção à saúde.