Introducción. El rotavirus es la causa más frecuente de diarrea grave en los niños. Son pocos los estudios clínicos sobre la relación entre la gastroenteritis por rotavirus y los grupos sanguíneos ABO. Objetivo. La meta de este estudio fue investigar la función de los grupos sanguíneos, en la incidencia de la gastroenteritis por rotavirus y la gravedad de la gastroenteritis. Métodos. Se realizó la investigación retrospectiva de las historias clínicas de los bebés que nacieron en nuestro hospital y a quienes, durante el seguimiento, se les diagnosticó gastroenteritis aguda. Resultados. En el estudio, se incluyeron 219 (36,3%) pacientes rotavirus positivos y 383 (63,6%) pacientes rotavirus negativos. El grupo sanguíneo A se detectó más frecuentemente en el grupo rotavirus positivo que en el grupo rotavirus negativo (50,6% frente a 42,2%, p= 0,047). Las tasas de hospitalización de los casos con gastroenteritis por rotavirus en los niños con el grupo sanguíneo A (30,6% frente a 8%, p < 0,001) fueron significativamente más altas. Conclusiones. Se determinó que la gastroenteritis por rotavirus fue más frecuente en los niños con el grupo sanguíneo A. Se detectó que las tasas de hospitalización de estos pacientes fueron más altas. Por lo tanto, en los niños con el grupo sanguíneo A, podría ser necesario estudiar cuidadosamente la gastroenteritis por rotavirus.