Las infecciones en niños trasplantados requieren un estudio particular debido a su compromiso inmunológico. En la Ciudad de México se realizan trasplantes renales, de hígado y de médula ósea en la población infantil, cada vez en mayor número. Lo anterior obliga a conocer las infecciones que los afectan con la finalidad de realizar mejor prevención de éstas. El éxito del procedimiento quirúrgico también puede verse afectado por la presencia de infecciones graves. La vigilancia de las infecciones que afectan a esta población infantil debe realizarse con métodos que permitan identificar la presencia de infecciones activas para poder brindar un tratamiento anticipado y prevenir el desarrollo de enfermedad. En esta revisión se presentan los aspectos más relevantes en la prevención y el manejo de las infecciones bacterianas y fúngicas en niños trasplantados.