Las infecciones virales y parasitarias en pacientes trasplantados tienen una morbilidad y mortalidad asociadas importantes y representan un alto costo en la atención médica de dichos padecimientos, ya que la mayoría requiere manejo hospitalario. La infección por citomegalovirus (CMV) se vigila en la actualidad mediante pruebas que permiten separar a los pacientes trasplantados que padecen infecciones activas de los que tienen infecciones latentes, como la antigenemia pp65 de CMV en leucocitos. La enfermedad linfoproliferativa por el virus de Epstein-Barr puede ser tratada en algunos casos sólo mediante la disminución de la inmunosupresión, pero en otros a través de la administración de quimioterapia. Las infecciones que ocurren en quienes reciben trasplante de médula ósea requieren un enfoque particular dada la neutropenia inicial con la que cursan y la enfermedad de injerto contra huésped en trasplantes alogénicos. Las infecciones en el xenotrasplante representan un campo de investigación interesante y menos explorado que las infecciones en otro tipo de trasplantes.