La pérdida y fragmentación del hábitat causada por la deforestación es un importante impulsor antropogénico de cambios sobre la biodiversidad en la selva amazónica. Sin embargo, la magnitud y dirección de los efectos sobre la composición y distribución de las especies aún es incomprendida. Evaluamos las respuestas de cuatro grupos taxonómicos - aves, anfibios, abejas de orquídeas y escarabajos peloteros - a la pérdida y fragmentación del hábitat, tanto a nivel de especies como de ensamblaje, en la Amazonía norte ecuatoriana. Tomamos muestras de quince parcelas de 250 m de largo en remanentes de bosque de tierra firme. Calculamos un índice de fragmentación del paisaje (fragindex), que considera la cobertura forestal continua, densidad del borde y el aislamiento en el paisaje, y nueve métricas de configuración del paisaje para analizar las respuestas de especies y ensamblajes. Más del 80% de las especies de aves, anfibios o abejas de orquídeas y el 60% de los escarabajos peloteros se vieron afectados negativamente por la pérdida y fragmentación del hábitat. La composición por especies se vio significativamente afectada por las diferencias en la cobertura forestal y la conectividad, mientras que la forma y el área de los parches de bosque determinaron la magnitud y la dirección del efecto en las respuestas de las especies. Por lo tanto, los cambios en la configuración del paisaje de la Amazonía ecuatoriana deben minimizarse para disminuir los efectos de la pérdida y fragmentación del hábitat sobre la presencia de especies y la composición de los ensambles. (AU)