Rev. Ciênc. Méd. Biol. (Impr.); 20 (3), 2021
Publication year: 2021
Introdução:
o sistema RANKL (receptor-ativador do fator nuclear-ligante κB)/RANK (receptor ativador do NF-kB)/OPG (osteoprotegrina) Introdução: o sistema OPG (osteoprotegrina)/RANK (receptor ativador do NF-kB)/RANKL (receptor-ativador do fator nuclear-ligante κB) regula os processos fisiológicos e patológicos da remodelação óssea. Polimorfismos genéticos nos genes OPG, RANK e RANKL têm sido associados a doenças, em diferentes populações. Objetivo:
Descrever a frequência e o potencial regulatório dos polimorfismos do sistema OPG, RANK e RANKL em uma população brasileira; avaliar o seu potencial como marcadores genéticos informativos de ancestralidade; comparar com patologias associadas em outras populações. Metodologia:
neste estudo, 506 indivíduos adultos, participantes de uma coorte acometidos de asma e periodontite, tiveram o DNA genômico extraído e genotipado, utilizando-se a plataforma Illumina. As plataformas NCBI, RegulomeDB, Haploview 4.2 e rSNPBase foram consultadas e utilizadas para análises.
Resultados e Discussão:
os polimorfismos mais frequentes na população estudada foram o rs3102724 no gene OPG, com frequência de menor alelo (MAF) de 46%; o rs4941129 em RANK, MAF 50%; e o rs9525641 em RANKL, MAF 46%. Os rs3134063 (1f) em OPG,
rs17069898 (1f) em RANK e rs2200287 (1d) em RANKL apresentaram maior impacto funcional. Em OPG e RANK, nove polimorfismos se caracterizaram como marcadores genéticos informativos de ancestralidade, com predomínio nas populações YRI (africanos) e CEU (europeus). Os nove polimorfismos, com função intrônica, apresentaram MAF entre 2 a 46% na população-alvo e foram associados a patologias do metabolismo ósseo em outras populações. Conclusão:
polimorfismos dos genes estudados se mostraram frequentes
na população estudada e tiveram seus alelos mais frequentes associados a doenças em populações ancestrais. Sugere-se que sejam realizados mais estudos.
Introduction:
The OPG (osteoprotegerin)/ RANK (NF-kB activating receptor)/ RANKL (nuclear-binding factor κB receptor-activating system regulates the physiological and pathological processes of bone remodeling. Genetic polymorphisms (SNPs) in OPG, RANK
and RANKL genes have been associated with diseases in different populations. Objective:
Describe the regulatory frequency and potential of SNPs in OPG, RANK and RANKL in a Brazilian population; assess their potential as informative genetic markers of ancestry;
compare with pathologies associated with these polymorphisms in other populations. Methods:
in this study, 506 adult individuals, participating in a cohort involving asthma and periodontitis, had genomic DNA extracted and genotyped using the Illumina platform.
The NCBI, RegulomeDB, Haploview 4.2 and rSNPBase platforms were consulted and used for analysis. Results and discussion:
the most frequent polymorphisms in the studied population were the rs3102724 in the OPG gene, with the lowest allele frequency (MAF)
of 46%; rs4941129 in RANK, MAF 50% and rs9525641 in RANKL, MAF 46%. The rs3134063 (1f) in OPG, rs17069898 (1f) in RANK and rs2200287 (1d) in RANKL, had greater functional impact. In OPG and RANK, 9 SNPs were characterized as informative genetic markers of ancestry, predominantly in YRI (African) and CEU (European) populations. These 9 SNPs, with intronic function, presented MAF
between 2 and 46% in our population, and were associated with pathologies in bone metabolism in other populations. Conclusion:
SNPs of the studied genes were found to be frequent in the studied population and had their most frequent alleles associated with
diseases in ancestral populations. It is suggested that further studies be carried out