Al conocer de manera detallada el desarrollo normal del sistema estomatognático y sus funciones, se crea un protocolo de evaluación para el neonato, que permita la identificación temprana de factores de riesgo y de posibles alteraciones. La validación de contenido se realizó a través del juicio de expertos, así mismo, se realizó el análisis de ítem y el análisis de confiabilidad a través del coeficiente de alfa de Cronbach. El estudio fue realizado con una población muestral de 400 neonatos, antes del egreso hospitalario; divididos en dos grupos según la edad gestacional. El diseño utilizado fue de tipo descriptivo- comparativo y la estadística utilizada fue no paramétrica, usando el estadístico de U de Mann – Whitney, con un valor de significación de mayor de 0.5 como regla de decisión para las comparaciones según la edad gestacional. A través del juicio de expertos se obtuvo un coeficiente entre 0.86 y 1.0 que denota la validez del mismo; la confiabilidad se realiza a través del alfa de Cronbach el cual alcanza un coeficiente de 0,892 constatando que es un instrumento altamente confiable, con adecuadas propiedades psicométricas. Se concluye el tipo de parto y edad gestacional influyen de manera determinante en el desarrollo de las funciones estomatognáticas primarias.