Testing accession genetic composition of a germ-plasm bank for mangabeira (Hancornia speciosa)
Validação da amostragem para composição de um banco de germoplasma de mangabeira (Hancornia speciosa)
Biosci. j. (Online); 36 (Supplement1), 2020
Publication year: 2020
The objective of the current study was to measure the genetic variability of natural populations of Hancornia speciosa using RAPD type molecular markers to assay variation in existing sampled genotypes, using morphological variables, and so assess germplasm bank composition. Morphological and chemical characteristics H. speciosa fruits and seeds were evaluated using descriptive statistics and principal components analysis. Cluster analyzes was conducted using Jaccard's similarity index, via the UPGMA hierarchical agglomerative method. Phenotypic variability was found in the two studied populations. However, variability was higher in the São Judas population, where the variables: pulp yield and soluble solids content were higher than those in the Canaã population. High genetic variability was found in both study populations, and between- and within-population morphological and genetic variation was present in the studied populations. The nine primers generated 70 bands, of which 68 were polymorphic, with the primers A-08 and C-04 generating the highest number of polymorphic bands. The two populations differ principally in the pulp ratio and the proportion of total solids in the pulp (°Brix). RAPD markers used gave acceptable results and, to initiate the Federal University of Tocantins Active Mangaba Germplasm Bank, seven genotypes were sampled from the Canaã population and five from the São Judas Tadeu population.
O presente trabalho teve como objetivo mensurar a variabilidade genética de populações naturais de Hancornia speciosa utilizando marcadores moleculares do tipo RAPD para validar a amostragem de genótipos, realizada por meio de variáveis morfológicas, para a composição de um banco de germoplasma. Foram avaliadas características morfológicas e químicas de frutos e sementes de mangaba, utilizando-se estatística descritiva e análise de componentes principais. As análises de agrupamento foram feitas utilizando índice de similaridade de Jaccard, através do método hierárquico aglomerativo UPGMA. Foi observada grande variabilidade fenotípica nas duas populações estudas, porém, essa variabilidade foi maior na população São Judas, onde as variáveis: rendimento de polpa e teor de sólidos solúveis foram maiores que os encontrados na população Canaã. Observou-se uma elevada variabilidade genética nas duas populações estudadas e que existe variabilidade morfológica e genética entre e dentro das populações. As duas populações diferem principalmente em relação ao rendimento de polpa e teor de sólidos solúveis totais (°Brix). Os nove iniciadores que amplificaram geraram 70 bandas, destas, 68 foram polimórficas, onde os primers A-08 e C-04 foram os que geraram maior número de bandas polimórficas. Portanto, os marcadores RAPD utilizados foram eficientes no presente estudo e para comporem o Banco Ativo de Germoplasma de Mangaba da Universidade Federal do Tocantins foram amostrados sete genótipos da população Canaã e cinco da população São Judas Tadeu.