El objeto de este artículo es reconstruir la existencia del hospital San Juan de Dios de Arequipa, que, a pesar de sus trescientos sesenta años de existencia al servicio de una de las ciudades más importantes del Perú, ha sido completamente olvidado por sus coterráneos y gran parte de los historiadores de la medicina peruana. Esta investigación permite igualmente apreciar la evolución administrativa, normativa y científica de un nosocomio colonial y, finalmente, experimentar en primera línea sus cuatro décadas finales, probablemente de las más tortuosas de su larga existencia en que se sobrevivió a sí mismo y que concluyeron de un modo insólito, nunca visto antes y después en los anales hospitalarios del país.