Introducción. La seguridad transfusional es el objetivo primordial de los bancos de sangre, sin embargo, conlleva un alto riesgo de eventos adversos como son las infecciones transmisibles por transfusión (ITT). El conocimiento de la prevalencia de estas infecciones fue de particular interés en esta investigación, donde se determinó su frecuencia, coinfección y relación con el tipo de donantes admitidos. Metodología. Estudio observacional retrospectivo de 2017 y 2018, en el que se incluyeron todos los registros de donantes de sangre que contenían datos demográficos y resultados de los marcadores obligatorios en el país (Ecuador), tanto de pruebas serológicas como moleculares. Se obtuvo el permiso del custodio de la información y del subcomité de bioética de investigaciones en seres humanos. Para el análisis de los datos se utilizó estadística descriptiva e inferencial. Resultados. Se determinó una prevalencia del 3,18 % de resultados reactivos para una o más ITT, el rango de edad más prevalente fue de 29 a 40 años, el 89,8 % fueron donantes compensatorios, y de ellos el 90 % fueron reactivos para una o más ITT. El marcador serológico más prevalente fue el anti-core del virus de la hepatitis B (anti-HBc), seguido por el de sífilis y los anticuerpos contra el virus de la hepatitis C (VHC). La coinfección más prevalente fue con sífilis y hepatitis B. Se encontró una diferencia estadísticamente significativa entre los resultados obtenidos en las pruebas serológicas y las moleculares (x2=26,9; p=0,000). Conclusión. Las ITT en los bancos de sangre son un riesgo latente, por lo que es necesario conocer las variaciones epidemiológicas que existen en cada población. El conocimiento de la prevalencia de las ITT en donantes de sangre permite establecer nuevas estrategias de selección del donante, que garanticen la mejor seguridad posible en las transfusiones, además debe verificarse siempre la metodología utilizada y hacer monitoreo permanente del sistema de calidad establecido