Para la identificación y determinación de la variabilidad genética de una población de 36 genotipos de onoto (Bixa orellana L. ) colectados de cinco regiones del país (Oriente, Centro, Llanos, Andes y Amazonas) y del Brasil; se utilizaron patrones de proteínas hidrosolubles e isoenzimáticos específicos (beta-esterasa, beta-esterasa y peroxidasa), partiendo de semillas germinadas de onoto, con radículas de 10 a 15 mm de longitud.

Cada sistema electroforético permitió la discriminación de genotipos con patrones de bandeo únicos:

las proteínas hidrosolubles y el sistema electroforético beta-esterasa con nueve patrones cada uno, mientras que beta-esterasa y peroxidasa, discriminaron ocho y tres genotipos, respectivamente. Por otra parte, la combinación de todos los sistemas electroforéticos permitió una mayor discriminación lográndose identificar a 34 de los 36 genotipos de onoto evaluados. Con el análisis de agrupamiento se logró la formación de ocho grupos muy heterogéneos, con una divergencia genética de un 40 a 60 %, no existiendo correspondencia entre el agrupamiento geográfico y el enzimático, posiblemente debido a la influencia antrópica en la distribución aleatoria de este cultivo. Los resultados obtenidos indicaron que con los patrones electroforéticos, se puede establecer un sistema de clasificación para identificar genotipos y determinar la variabilidad genética existente en esta especie.