El propósito de esta investigación fue comprender las dificultades y necesidades para el aprendizaje de las ideas principales de la Anatomía Macroscópica Humana AMH. Se investigó un grupo de 90 estudiantes de segundo semestre del programa académico de Medicina y Cirugía de una Universidad pública, quienes se encontraban cursando la asignatura de Anatomía Macroscópica Humana I, para ello se tuvo en cuenta el modelo del conocimiento pedagógico del contenido PCK que incluye el conocimiento de los estudiantes, de su comprensión de la AMH, se realizó una observación participante de las clases teóricas y prácticas durante 16 semanas, llevando a cabo los registros de la observación en diario de campo y se obtuvo material audiovisual. Posteriormente se elaboró un índice analítico, se transcribió la información, todos los documentos fueron analizados por medio del software para análisis ATLAS.ti. Se encontraron aspectos de la enseñanza que dificultan el aprendizaje, como son la metodología de enseñanza, la gran cantidad de contenido abordado en la asignatura, la dificultad en la comprensión de las descripciones y complejidad de la ubicación espacial de las piezas anatómicas, la dificultad para encontrar una metodología de estudio apropiada y la falta de concentración durante las clases. El comprender la complejidad del proceso de aprendizaje puede favorecer la planeación y desarrollo de la enseñanza y la evaluación.