Introducción. Los pacientes con patología abdominal quirúrgica que requieren manejo con abdomen abierto son susceptibles a la pérdida de proteínas desde la cavidad expuesta. El objetivo de este estudio fue caracterizar la pérdida proteica a través de dos tipos de cierre temporal abdominal. Métodos. Se realizó un estudio decohorte prospectivo, con pacientes críticos manejados durante el año 2021 con abdomen abierto mediante dos tipos de cierre temporal: bolsa de Bogotá y ABThera™. Se recolectaron muestras intraoperatorias seriadas de líquido peritoneal (días 1, 3 y 5). Se calcularon frecuencias y promedios, y se compararon con las pruebas de Chi cuadrado y t de Student. Resultados. Se incluyeron 25 pacientes. El promedio de pérdida de proteínas en líquido peritoneal fue mayor con el sistema ABThera™ (44,38 g/L) comparado con la bolsa de Bogotá (25,18 g/L; p=0,0185). Durante el seguimiento se observó la tendencia a la disminución del promedio de proteínas perdidas por ambos sistemas, pero con ABThera™ se perdieron en promedio 15,47 gr/L más de proteínas, independientemente del estado nutricional y del aporte proteico recibido (p=0,042). No hubo diferencias según la etiología que llevó al manejo con abdomen abierto, los procedimientos quirúrgicos realizados o el estado de infección por COVID-19. Conclusiones. El abdomen abierto representa una fuente importante de pérdida de proteínas, que es diferente según el tipo de cierre temporal usado. Estas pérdidas deberían considerarse en los cálculos de soporte nutricional en la unidad de cuidado intensivo.