El objetivo de este estudio es describir la composición de la microbiota anaerobia estricta/aerotolerante en infecciones endodónticas primarias, su susceptibilidad antimicrobiana, y la asociación con los parámetros clínicos. Se tomaron muestras de siete pacientes con necrosis pulpar sintomática o asintomática. Se utilizaron técnicas para la conservación, cultivo, incubación e identificación de anaerobios estrictos/aerotolerantes. Para determinar la susceptibilidad antimicrobiana a amoxicilina y metronidazol, se utilizó el método de dilución en agar. Se aislaron un total de 32 cepas, 20 (62,5 %) fueron anaerobios estrictos/aerotolerantes, y 8 (25 %) anaerobios facultativos. El microorganismo anaerobio estricto/aerotolerante más frecuente fue Fusobacterium nucleatum, se aisló en tres casos, todos relacionados con algún tipo de dolor, y en dos casos estuvo relacionado con Prevotella spp. Se encontró una colonia de F. nucleatum resistente a amoxicilina y con producción de ß-lactamasa, y otra de F. nucleatum resistente a metronidazol. Una colonia de P. propionicum/avidus presentó resistencia intermedia a amoxicilina y con producción de ß-lactamasa. Se encontró la presencia de bacterias anaerobias estrictas/aerotolerantes en los pacientes con infecciones endodónticas primarias. Existen algunos microrganismos relacionados con algún tipo de dolor, como F. nucleatum y P. micra. Los hallazgos muestran presencia de F. nucleatum resistentes a los antimicrobianos evaluados.