Es posible entender al hospital como un ecosistema. Ecología es el estudio científico de la interacción que determina la distribución y abundancia de los organismos en su locus. Medicamentos, particularmente los antibióticos, tienen una fuerte influencia en él. La flora normal, de los pacientes hospitalizados, sufre transformaciones. La principal fuente de micoorganismos emergente en el paciente internado es la micorbiota humana. La razón es una necesidad imperiosa de cambio y adaptación a las condiciones cambiantes del medio ambiente. Las caractrísticas de virulencia y epidemicidad de los diferentes microorganismos que componen los nichos harán que dominene el escenario hospitalario. Son aquellas que frente a la debilidad del paciente toman un comportamiento oportunista