El objetivo de esta investigación fue realizar tamizaje neonatal para detectar neonatos con Hipotiroidismo Congénito en el área de influencia de la Universidad el Bosque, confirmar el diagnóstico, iniciar tratamiento temprano y realizar seguimiento, previniendo las respectivas consecuencias. Se recolectaron datos de las historias clínicas y muestras de TSH en sangre total de talón en 2400 recién nacidos vivos, después de 24 horas de vida, desde noviembre de 1999 hasta junio de 2001 en neonatos de bajo riesgo y desde febrero de 2001 hasta febrero de 2002 en neonatos de alto riesgo. Se tomó con criterio de alto riesgo todo neonato que ingresara al área de recién nacidos. Se informó a los padres mediante visita y folleto de difusión. La muestra se procesó en el laboratorio de biología Molecular empleando la técnica microELISA tipo sándwich para TSH y RIA para T4 en los casos a confirmar y con punto de corte de 20 mUI/ml. Para el análisis estadístico de los resultados se utilizó SPSS versión 8.0 para Windows. Entre los resultados más sobresalientes está la prevalencia, de 2 en 2400 recién nacidos vivos, dato similar al descrito por la literatura. Se encontró dependencia estadísticamente significativa entre el tiempo de toma de la muestra y los valores de TSH en talón. No se encontró dependencia de los casos positivos de hipotiroidismo congénito primario y las poblaciones de alto y bajo riesgo neonatal. Como conclusión, es necesario implementar y ejecutar programas de tamizaje neonatal, teniendo en cuenta sus invaluables beneficios.