Este estudio evaluó la presencia de Trypanosoma evansi y Trypanosoma vivax en búfalos de agua (Bubalus bubalis) y chigüires (Hydrochoerus hydrochaeris) de tres estados de Venezuela por técnicas parasitológicas y moleculares (frotis teñido: FT; microcentrifugación capilar: TMC; reacción en cadena de la Polimerasa: PCR), estableciéndose el porcentaje de infecciones activas. En 316 muestras sanguíneas de búfalos las tasas de detección para FT, TMC y PCR fueron de 20 (6,33 por ciento), 36 (11,39 por ciento) y 60 (18,98 por ciento),respectivamente. Por PCR se caracterizó a T. vivax como la especie responsable de todas las infecciones, no detectándose presencia de T. evansi. En 186 muestras de chigüires FT y TMC identificaron positividad en 36 (19,35 por ciento) y 71 (38,17 por ciento) de estas, respectivamente, con altas parasitemias; en 27 de estas se observaron tripanosomas del Subgénero Megatrypanum. Por PCR se caracterizaron como T. evansi 51 muestras de chigüires, seis con resultados TMC-negativo. No se detectó T. vivax en chigüires. Un análisis de t-student estableció diferencias (p<0.05) entre los valores de hematocrito (Ht) de búfalos positivos y negativos a tripanosomas; mientras que por análisis de varianza se detectó efecto (p< 0.05) del grado de parasitemia sobre el Ht. No hubo ningún efecto (p>0.05) al realizar los mismos análisis para las muestras de chigüires.