La implementación de técnicas de amplificación de ácidos nucleicos (NAT) para la detección de Virus de Hepatitis C (VHC) y Virus de Inmunodeficiencia Humana (VIH) en el tamizaje de donantes de sangre permite acortar los períodos ventana para los ensayos utilizados en la detección de antígenos y/o anticuerpos, identificando donaciones infectivas y evitando su transfusión. Todos los usuarios de NAT deben proceder a su validación para investigar si los procedimientos involucrados cumplen y garantizan confiabilidad en la reducción del período ventana en unidades de hemocomponentes factibles de ser transfundidas. El objetivo de este trabajo fue mostrar los resultados obtenidos de la implementación de técnica NAT in house validadas frente a estándares internacionales para la detección de VHC y VIH en donantes de sangre. Los resultados fueron analizados con el software Probit analysis programs. Para un 95% de positividad, el límite de detección fue de 98,50 Ul/ml para VHC y 294, 84 Ul/ml para VIH. La especificidad fue del 100% y los procedimientos presentaron robustez. La validación de técnicas de PCR in house permite demostrar que, por sensibilidad y especificidad, son una alternativa válida y aplicable en el tamizaje de donantes de sangre.