A comienzos de la epidemia del Síndrome de Inmunodeficiencia Adquirida (SIDA), el Pneumocytis carinii era la causa más común de infección respiratoria en estos pacientes. Realizar el diagnóstico etiológico de la infección respiratoria baja (IRB) en pacientes con infección por virus de inmunodeficiencia humana (VIH) usando aspiración transtraqueal (ATT) como método diagnóstico. Estudio epidemiológico clínico, analítico, descriptivo, prospectivo que evaluó las manifestaciones clínicas y hallazgos de laboratorio, gasometría y radiología en 15 pacientes que ingresaron al Hospital Dr. Domingo Luciani entre enero y marzo de 1998, con IRB e infección por VIH al ingreso y días 7,14 y 30 siguientes. Se realizó ATT como método diagnóstico etiológico de IRB, con examen directo, coloraciones especiales y cultivos para bacterias, tuberculosis y hongos a todas las muestras obtenidas. Ningún paciente presentó complicaciones por este procedimiento. En 9 pacientes se determinó la etiología infecciosa, con predominio bacteriano (Pseudomona aeruginosa, 2 Staphylococcus aureus, 2; Nocardia asteroides, 2; Streptococo beta del grupo A, 1; Escherichia coli, 1; Esterobacter arogenes, 1; y Pneumocystis carinii, 1. Nuestro estudio evidencia la frecuencia bacterianas en pacientes con infección por VIH e IRB