La microsporidiosis humana ha cobrado relevancia clínica con la aparición del virus de la inmunodeficiencia humana. La diarrea crónica constituye la expresión clínica más frecuente es estos pacientes aunque se han descrito infecciones localizadas en los distintos parénquimas del organismo e infecciones generalizadas. Las especies más relevantes son enterocytozoon bieneusi y encephalitozoon intestinalis. Se plantean como desafíos definir claramente los métodos diagnósticos y terapia adecuadapara ambas especies, una eventual terapia profiláctica primaria y/o secundaria y actualizar además las cifras de prevalencia en los distintos países