Debido a la importancia turística y socioeconómica de los canales de Tortuguero para la provincia de Limón, pero sobre todo a que este sistema de agua sirve como cuerpo receptor de los ríos Colorado, Tortuguero, Reventazón-Parismina, Pacuare y Matina, se presenta este estudio con el objetivo de determinar el grado de contaminación fecal de dichos canales. Para cumplir con el mismo se ubicó 10 estaciones de muestreo a lo largo de los 122 kilómetros, antes y después de las desembocaduras de los ríos mencionados. Los resultados de los análisis indican que en su mayor parte son buenos para ser utilizados como fuentes de agua para potabilización, pero no para la natación ni el cultivo de peces, pues muy pocos puntos de muestreo son aceptables para la irrigación de cultivos para consumir crudos, y no se pueden utilizar para agua de consumo humano sin previo tratamiento.