Seqüenciamento e análise filogenética de 17 amostras do vírus da diarréia viral bovina (BVDV) isoladas no Brasil identificaram quatro amostras (23,5 por cento) do genótipo 1a (BVDV-1a), nove amostras (52,9 por cento) do genótipo 1b (BVDV tipo 1b) e quatro amostras (23,5 por cento) do genótipo 2 (BVDV tipo 2). As amostras brasileiras de BVDV tipo 2 apresentaram-se genotipicamente distintas dos BVDV tipo 2 até entäo identificados na América do Norte e Europa, sugerindo pertencerem a um novo subgenótipo. A caracterizaçäo antigênica dessas amostras por neutralizaçäo cruzada revelou reatividade sorológica muito reduzida com cepas vacinais do BVDV. O anti-soro produzido contra três cepas vacinais do BVDV apresentou atividade neutralizante muito reduzida contra várias amostras brasileiras de BVDV tipo 1 e 2. Diferenças de até 128 vezes nos títulos de anticorpos neutralizantes foram observadas entre cepas vacinais e amostras brasileiras do BVDV. Nos testes de soroneutralizaçäo (SN) contra o vírus dos tipos 1 e 2, de 1134 amostras testadas, 280 (24,7 por cento) possuiam anticorpos neutralizantes anti-BVDV e dessas, 215 (76,8 por cento) apresentaram atividade neutralizante contra ambos os vírus, 37 (13,2 por cento) reagiram apenas contra o BVDV tipo 2 e 28 amostras (10 por cento) foram positivas apenas contra o BVDV tipo 1. Esses resultados demonstram que testes de SN utilizando vírus de apenas um genótipo podem resultar em número significativo de falsos-negativos e indica a necessidade da formulaçäo de vacinas com amostras locais de BVDV e/ou contendo vírus dos dois genótipos