Não existe o cisto periodontal lateral inflamatório na parte lateral das raízes, tal como se forma o cisto periodontal apical a partir de um granuloma periapical imunogênico. O cisto periodontal lateral é um cisto do desenvolvimento derivado de restos da lâmina dentária localizados no ligamento periodontal, com crescimento limitado e sem natureza inflamatória. O dente associado tem vitalidade pulpar e o tratamento da lesão não requer uma abordagem endodôntica terapêutica, apenas sua remoção cirúrgica, o que já constitui uma biopsia excisional. A análise microscópica é fundamental quando for removido o cisto periodontal lateral, pois, quando incipientes, algumas lesões como o ameloblastoma, o queratocisto odontogênico e o tumor odontogênico escamoso podem apresentar-se com a mesma imagem e aspectos clínicos. O prognóstico do cisto periodontal lateral é muito bom e geralmente não há recidiva, mas o prognóstico dessas outras lesões inclui as recidivas ao longo do tempo e uma agressividade clínica maior para o paciente.