Nas zonas rurais o abastecimento de água é feito principalmente através da utilização de poços rasos ou nascentes. Apesar de serem consideradas muito puras, estas águas podem se contaminar durante o processo de captação ou seu trajeto até o consumo. Muitas vezes se faz necessário que se proceda ao tratamento desta água, sendo os compostos a base de cloro os mais usados para esta finalidade. Neste trabalho avaliou-se a qualidade microbiológica da água de poços rasos e/ou nascentes de pequenas propriedades rurais de São João da Boa Vista - SP, determinando as características microbiológicas da água ôin naturaö utilizada para o consumo humano e animal; orientando tecnicamente quanto a construção de poços rasos e a captação de nascentes e quanto a melhoria da qualidade microbiológica destas águas através do uso de um sistema de cloração; acompanhando as melhorias obtidas após aplicação do tratamento. Realizou-se a análise da qualidade microbiológica da água de 101 propriedades rurais do município, compreendidas entre 5,1 e 40 hectares e que utilizavam para consumo humano e animal água proveniente de poços rasos e nascentes, através de análises para coliformes totais e fecais pelo método de tubos múltiplos e contagem total de microrganismos heterotróficos. Pelos resultados obtidos, quando comparados ao padrão Federal, pode-se afirmar que a água proveniente dos lençóis subterrâneos das propriedades avaliadas, apresentaram precária qualidade higiênico-sanitária. As nascentes apresentaram menores índices de contaminação quando comparados as amostras provenientes de poços, evidenciando que estes são passíveis de contaminação mais facilmente que a água captada em nascentes.