A cirurgia ortognática pode alterar a auto percepção do paciente com deformidades dento-faciais. O objetivo deste trabalho foi determinar o impacto das fases do tratamento ortodôntico-cirúrgico na qualidade de vida e autoestima de pacientes de cirurgia ortognática. Este estudo observacional transversal incluiu 80 pacientes com deformidades dento-faciais em várias fases do tratamento de cirurgia ortognática que foram divididos em 4 grupos (n = 20 cada): Grupo 1, pré-tratamento ortodôntico; Grupo 2, pré-cirurgia; Grupo 3, pós-cirurgia ortognática; e Grupo 4, após remoção do aparelho ortodôntico. Sua qualidade de vida foi avaliada por meio do Perfil de Impacto em Saúde Oral (OHIP-14), do Questionário de Qualidade de Vida em Cirurgia Ortognática (OQLQ). A autoestima, pela Escala de Autoestima de Rosenberg (RSE), validados para o português do Brasil. Foram aplicados testes estatísticos para comparação entre os grupos, com nível de significância de p < 0,050. Houve diferença estatisticamente significante entre os grupos para o OHIP-14 (p = 0,001) e o OQLQ e seus domínios (p= <0,001), com diminuição dos valores nos grupos 3 e 4. Os valores da RSE (p= 0,001), aumentaram nos grupos 3 e 4. Os pacientes apresentaram média de idade de 29,4 anos e predomínio do sexo feminino (68,8 %). A variável sexo apresentou diferença estatisticamente significante para o OHIP-14 e o OQLQ em alguns grupos. Assim, podemos concluir que houve melhora significante na qualidade de vida e na autoestima nas fases após a cirurgia ortognática e após a remoção do aparelho ortodôntico.