En El Salvador, la tuberculosis (TB) continúa siendo un problema de salud pública, cada año son diagnosticados entre 3,000 a 3,500 personas de las cuales, mas del 40% están al interior del sistema penitenciario y el 16% (500 casos) en el Instituto Salvadoreño del Seguro Social y el 39% en la red de establecimientos del MINSAL. Del total de los casos del 2020 el 56% se diagnosticó a través de pruebas moleculares (gene Xpert), el 46% con baciloscopias y menos del 2% por cultivo. A través de la red de laboratorio a nivel nacional, existen 215 laboratorios que realizan baciloscopías, 24 que realizan cultivo BAAR y 11 que realizan pruebas moleculares. Desde el año 1997 El Salvador implementó la estrategia de Tratamiento Acortado Estrictamente Supervisado (TAES), la cual es aplicada en toda la red de los servicios de salud: Seguridad Social, Centros Penales, Bienestar Magisterial, Hospitales Privados; ser costo efectivo puesto que evita la hospitalización, llegando a alcanzar tasas de éxito en el tratamiento arriba de 93%, superando la meta mundial del 90% recomendada por la OMS. A partir del 12 de marzo del 2020, El Salvador declaró emergencia nacional para hacerle frente a la pandemia del COVID-19, siendo una enfermedad respiratoria al igual que la tuberculosis, las intervenciones realizadas en el control de infecciones y medidas de aislamiento contribuyen al control de ambas enfermedades. El Programa Nacional de Tuberculosis (PNTYER) ha realizado durante el mes de marzo 2,876 pruebas a través del método del Gene Xpert MTB/Rif para detectar M. tuberculosis, de las cuales han resultado 151 personas positivas a la enfermedad, de las cuales 89 (59%) corresponde a personas privadas de libertad. De las 151 personas detectadas con tuberculosis, 96 corresponden al periodo del 12 al 31 de marzo, durante el periodo de cuarentena actual. Hasta el momento no hay evidencia referente a la coexistencia del binomio TB y COVID-19. Debido a la expansión del COVID-19 en la Región, El Salvador implementó los centros de contención de personas con sospecha de COVID 19, para evitar su propagación. Durante este período de emergencia se debe garantizar el acceso a una atención integral centrada en el paciente con signos y síntomas respiratorios, sin olvidar una de las principales actividades del Programa, la detección precoz y tratamiento oportuno de la TB, con medidas y enfoque pluripatológico (un Sintomático Respiratorio podría tener TB, COVID-19, otra coinfección u otra comorbilidad) para lo cual los servicios de salud deben dar respuesta inmediata tanto con el abordaje diagnostico (con realización de baciloscopias, cultivos, Gene Xpert) como el control de infecciones, manejo y referencia del paciente, haciendo hincapié en la bioseguridad del personal en la toma, manejo y envío de muestras.