El plan se basa en la guía metodológica para la formulación de los planes estratégicos institucionales 2012-2016 del Ministerio de Salud, y se vincula con los objetivos nacionales del plan bicentenario al 2021.

El marco estratégico del hospital tiene cuatro pilares:

Atención integral de salud especializada, Docencia en servicios, Investigación científica y tecnológica y Calidad en la atención. Asimismo, contiene el diagnóstico del entorno externo e interno, objetivos y acciones estratégicas para este quinquenio