Padronização da detecção molecular de Sars-Cov-2 em amostras de escarro de pacientes com suspeita de tuberculose em população privada de liberdade na região do ABC/SP
Standardization of molecular detection of Sars-Cov-2 in sputum samples from patients with suspected tuberculosis in a population deprived of liberty in the ABC/SP region
Publication year: 2022
Theses and dissertations in Portugués presented to the São Paulo (Estado) Secretaria da Saúde. Coordenadoria de Controle de Doenças. Programa de Pós-Graduação em CIências to obtain the academic title of Mestre. Leader: Silva, Erica Chimara
A tuberculose (TB) é das principais causas de morbidade e mortalidade no mundo, especialmente em países em desenvolvimento. O diagnóstico e o tratamento podem evitar milhões de mortes todos os anos. Há dois anos o SARS-CoV-2, um vírus que provoca uma infecção viral altamente transmissível e patogênica, que causa a doença denominada
COVID-19 (relativa ao Coronavírus-19), causou a perda de um grande número de vidas em todo o mundo. Conforme a OMS, aproximadamente 80% dos acometidos pelo SARS-CoV-2 variaram de casos assintomáticos e manifestações clínicas leves a moderados, graves e críticos, e muitos foram a óbito. Sendo assim, é necessária atenção especial aos sinais e sintomas que indicam piora do quadro clínico e exijam a hospitalização. A infecção
pelo Mycobacterium tuberculosis (MTB), principal agente da TB, que infecta de forma latente cerca de 25% da população global, incluindo a população privada de liberdade (PPL), pode ser um dos fatores agravantes da infecção pelo SARS-CoV-2. Esse estudo teve como objetivo padronizar, na plataforma GeneXpert, a utilização de amostras de escarro no diagnóstico molecular para detecção do SARS-CoV-2. A utilização do escarro para diagnóstico de SARS-CoV-2 poderá trazer benefícios ao paciente por ser uma coleta não invasiva, proporcionar a detecção de TB no mesmo material, permitindo o rápido isolamento do paciente para evitar transmissão e empregar o tratamento correto. Foram testadas 100 amostras de escarro de PPL para diagnóstico de TB e pesquisa de COVID-19 por metodologia padrão ouro (RT-qPCR) e teste rápido molecular (TRM-COVID). Destas, 12 amostras foram positivas para SARS-CoV-2 pela metodologia RT-qPCR e 13 amostras pelo TRM-COVID. Sete amostras foram positivas para o complexo Mycobacterium tuberculosis (CMTB) no TRM-TB e confirmadas pela cultura em meio líquido. Foi detectado um caso de coinfecção TB/COVID-19. O TRM-COVID apresentou sensibilidade de 90,9% quando utilizadas amostras de escarro para o diagnóstico da COVID-19. O teste pode agilizar o início do tratamento e os resultados rápidos permitem o 13 isolamento de indivíduos, a detecção de coinfecções TB/COVID-19 e o diagnóstico diferencial entre as doenças. (AU)
Tuberculosis (TB) is one of the main causes of morbidity and mortality in the world, especially in developing countries. Diagnosis and treatment can prevent millions of deaths every year. Two years ago, SARSCoV-2, a virus that causes a highly transmissible and pathogenic viral infection, which causes the disease called COVID-19 (relating to
Coronavírus-19), caused the loss of a large number of lives throughout the world. According to the WHO, approximately 80% of those affected by SARS-CoV-2 ranged from asymptomatic cases and mild clinical manifestations to moderate, severe and critical, and many died. Therefore, special attention is needed to the signs and symptoms that indicate a
worsening of the clinical condition and require hospitalization. Infection with
Mycobacterium tuberculosis (MTB), the main agent of TB, which latently infects about 25% of the global population, including the population deprived of liberty, may be one of the aggravating factors of SARS-CoV-2 infection. This study aimed to standardize, on the GeneXpert platform, the use of sputum samples in molecular diagnosis for the detection of SARS-CoV-2. The use of sputum for diagnosis of SARS-CoV-2 may bring benefits to the
patient as it is a non-invasive collection, providesthe detection of TB in the same material, allowing the rapid isolation of the patient to avoid transmission and employ the correct treatment. 100 sputum samples were tested from individuals deprived of liberty were tested for TB for TB diagnosis and COVID-19 research by gold standard methodology (RT-qPCR) and rapid molecular test (TRM-COVID). Of these, 12 samples were positive for SARSCoV-
2 by the RT-qPCR methodology and 13 samples by the TRM-COVID. Seven samples were positive for Mycobacterium tuberculosis complex (CMTB) on TRM-TB and confirmed by culture in liquid medium. One case of 15 TB/COVID-19 co-infection was detected. TRM-COVID showed a sensitivity of 90,9% when using sputum samples for the diagnosis of COVID-19. The test can expedite treatment initiation, and rapid results allow for isolation of
individuals, detection of TB/COVID-19 co-infections, and differential diagnosis between diseases. (AU)