El megacolon es una de las manifestaciones clínicas de la etapa crónica de la enfermedad de Chagas, cuyo agente etiológico es el Trypanosoma cruzi. Se postula de que las manifestaciones clínicas en la enfermedad de Chagas sean producto de un proceso autoinmune, debido a que no se identifica fácilmente la presencia de parásitos en el tejido afectado de pacientes crónicos. Con el objeto de detectar la presencia del T. cruzi en segmentos colónicos quirúrgicamente resecados de individuos chagásicos crónicos se emplearon técnicas moleculares como la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) e hibridación con sondas específicas en muestras de tejido parafinado de 10 pacientes con megacolon chagásico. de cada segmento se estudiaron 5 secciones diferentes teniendo en cuenta el número de células ganglionares afectadas. Se detectó por Southern blot la presencia de ADN de T. cruzi en 7 de los 50 secciones analizadas. No se observó una correlación entre la presencia de parásitos y la alteración del número de células ganglionares y en ningún caso analizado se ha detectado la presencia de parásitos en sangre circulante. Se demuestra por vez primera la presencia de T. cruzi en tejido parafinado de pacientes con megacolon chagásico