A presente pesquisa resulta do exame de 585 lesões pulmonares através da punção aspirativa por agulha fina(PAAF) realizadas no Hospital universitário Oswaldo Cruz, da Faculdade de Ciências Médicas da Universiade de Pernambuco, Recife, Pernambuco, no período de janeiro de 1992 a junho de 1996. Desses casos 380 eram malígnas. Foram selecionadas 68 casos de carcinomas mal diferenciados diagnosticados e subtipados pelo exame de rotina citopatológico, acrescido da técnica de bloco celular. Seguiu-se a caracterização e imunohistoquímica e por hibridização molecular in situ. O estudo imunohistoquímico foi procedido pela técnica PAP utilizando-se marcadores monoclonais para citoqueratina (CQ), antígeno carcino-embrionário (CEA), antígeno de membrana epitelial (EMA), vimentina (VIM), enolase neurônio-específica (ENO), desmina (DM), proteína S-100 (S-100) e antígeno leucocitário comum (CD45). A hibridização molecular in situ foi realizada com sistema de amplificação da catalase com sondas não radioativas de DNA, do tipo alfa-satélite específicas para as regiões pericentroméricas do cromossomo 3, com tecnica modificada na qual um fenol biotinilizado reage com o complexo streptavidina-biotina, o que permitiu colocar maior número de moléculas de peroxidas e no sítio da reação. Essa amplificação tornou possível a hibridização in situ em materiais de rotina (esfregaços e blocos celulares), com revelação através da peroxidade, levando à visualização conjunta da morfologia celular e do sinal cromossômico. A pesquisa permitiu caracterizar os carcinomas mal diferenciados do pulmão, tanto o de células pequenas, como o de células grandes pelo seu imunofenotipo e por características específicas do cromossomo 3