La reacción en cadena de la polimerasa PCR en el diagnóstico de la enfermedad de Chagas fue evaluada con 70 muestras del Banco de Sangre de la clínica San Pedro Claver. el estudio se realizó durante los meses de febrero a junio de 1999. La PCR se comparó con dos técnicas serológicas Chagatek ELISA e IFI utilizadas como patrón de oro. Se utilizaron los primers S35 y S36 que amplifican un segmento de 330 pb de los minicírculos de la región conservada del T. cruzi. Con estos se pudo detectar hasta 0,1 fg de ADN de T. cruzi que equivale a 1/33 partes de un parásito y podría detectar hasta un parásito de 10 ml de sangre, con los primes S35 y S36 se hizo diferenciación de una infección de T. rangeli y T. cruzi, en una muestra reportada positiva por Chagatec ELISA y negativa por IFI; la posibilidad de una infección mixta fue aclarada utilizando un gel de poliacrilamida al 6 por ciento obteniendo solo las bandas características de T. rangeli. Se observó una gran diferencia en los resultados positivos reportados por PCR y Chagatek ELISA, al igual que los resultados entre las pruebas IFI y Chagatek ELISA posiblemente debidos a la alta sensibilidad del PCR e IFI, se presume la gran cantidad de falsos positivos que se pueden estar presentando por Chagatek ELISA. La PCR presentó una alta sensibilidad 91,7 por ciento y especificidad 100 por ciento con relación a las dos técnicas serológicas Chagatek ELISA e IFI, asi como también se observó una mayor correlación entre PCR vs (0,94) IFI, que entre PCR vs Chagatek ELISA (0,40) o entre las técnicas serológicas Chagatek ELISA e IFI (0.34). Con este estudio se sugiere que la PCR podría ser utilizada como técnica para confirmar el diagnóstico de la enfermedad de Chagas