Esta tese é composta por quatro trabalhos de epidemiologia molecular do HIV-1 No primeiro trabalho, relatamos o caso de um paciente exposto a sangue contaminado por HIV-1 de dois diferentes doadores. Utilizando a amplificação por PCR das regiões tat e V3 do env do HIV-1 e posterior análise por seqüenciamento do DNA e/ou análise da mobilidade dos heteroduplexes (HMA), encontramos evidências de que este tenha se infectado por apenas um destes doadores. No segundo estudo, usamos a HMA do primeiro exon do gene tat para traçar relações epidemiológicas entre indivíduos infectados pelo HIV-1. Uma série de painéis compostos de amostras foi usada para comparar a HMA intra-pacientes, intra-grupos e entre os grupos , demonstrando que este método era suficientemente específico para ser utilizado como uma triagem de parentesco entre os vírus isolados de diferentes indivíduos. No terceiro estudo, 551 amostras de doadores ou receptores de derivados de sangue detectadas como HIV positivas nos EUA foram submetidas a HMA e seqüenciamento do DNA, para determinação de prevalência dos diferentes subtipos do grupo M do HIV-1.

535 tiveram seu subtipo determinado:

Três doações pré-tríadas foram designadas como subtipos não B (2 As, l C). No último trabalho, descrevemos um caso no qual reatividade transitória do ELISA de HIV l e 2 de terceira geração e um resultado indeterminado no Western blot foram detectados em uma amostra de sangue coletada de uma profissional de saúde duas horas após ter sido exposta à sangue HIV positivo. Demonstramos com estudos de seqüenciamento e HMA que a profissional havia, de fato, se infectado no momento do referido acidente