Após preparo biomecânico endodôntico, é imprescindível que a escolha dos componentes da obturação seja feita com critério em relação à compatibilidade biológica, visando tornar o processo reparacional mais rápido e efetivo. Este estudo teve o propósito de analisar as reações teciduais apicais e periapicais em pré-molares de cães, após pulpectomia e preparo químico-cirúrgico, cujo limite foi definido em nível do delta apical, e obturação com cones de guta-percha e dois cimentos contendo hidróxido de cálcio, Sealapex® e Apexit®. Foram analisados os eventos histopatológicos em períodos de sete, vinte e um e quarenta e cinco dias, comparando os fenômenos de inflamação e de reparação. Decorridos os períodos de observação, os cães foram mortos e as peças processadas para análise histológica. Empregando-se análise quantitativa-qualitativa, verificou-se que o cimento Sealapex promoveu inflamação entre discreta e moderada em todos os períodos, tendo uma melhora significativa na evolução da colagenização aos 45 dias. Houve maior dispersão no tecido periapical do cimento Apexit, que promoveu intensa atividade macrofágica na área, intensificando os fenômenos de inflamação, mesmo aos 45 dias. Ambos cimentos provocaram necrose em algumas ramificações do delta apical, sendo em maior número nos dentes obturados com Apexit. Da comparação entre o emprego dos dois cimentos, o Sealapex foi o que apresentou melhor tolerância tecidual e, por conseqüência, evolução reparacional mais favorável.