O objetivo desta dissertação de mestrado é desenvolver mecanismos de descentralização da atividade de planejamento estratégico no Instituto de Pesquisa Clínica Evandro Chagas – IPEC/FIOCRUZ. Concebida como um estudo de caso, a pesquisa recorreu, em primeiro lugar, à chamada Nova Economia da Ciência, com vistas a identificar as potenciais conseqüências de fatores externos influentes sobre o modelo de gestão da FIOCRUZ: a reforma do Estado; as novas políticas de C&T e Inovação; a mudança da organização da pesquisa; e a regulação por avaliação de desempenho. Em segundo lugar, utilizou elementos da Teoria das Organizações, com vistas a caracterizar as potenciais conseqüências da pesquisa estratégica, da gestão segundo resultados e do planejamento estratégico sobre a reestruturação da FIOCRUZ e sobre a organização interna do IPEC. Como resultado, foram submetidas aos gerentes do IPEC, através de roteiro de entrevista em profundidade, a hipótese de descentralização vertical seletiva do planejamento estratégico do Instituto, além de prescrições quanto à operacionalização deste modelo de planejamento. As evidências obtidas são no sentido da receptividade dos gerentes à doutrina, ao método e à descentralização do planejamento estratégico como princípio, assim como da confiança e da cautela quanto ao mecanismo de descentralização vertical seletiva proposto.