Os papilomavírus humanos (HPV) estão associados a diversas lesões do trato anogenital, tanto malignas quanto benignas. A imunodeficiência, como a encontrada em pessoas portadoras de HIV é um fator de risco para infecções genitais por HPV e sua progressão para neoplasias intra-epiteliais e cânceres genitais. O objetivo do presente estudo foi avaliar através de técnicas de biologia molecular, a prevalência da presença de DNA-HPV no sangue periférico entre as gestantes HIV-1 positivo. Um total de 60 gestantes HIV-1 positivo com infecção cervical positivo por HPV e 50 gestantes HIV-1 positivo sem infecção cervical por HPV apresentavam resultados de pesquisa de HPV cervical pelos métodos moleculares (Captura Híbrida-II e PCR/RFLP) e contagem de células CD4+ e carga viral do HIV-1 do plasma. As amostras disponíveis de sangue periférico das gestantes selecionadas foram submetidas à Nested-PCR seguido de sequenciamento para a pesquisa de DNA-HPV. A DNA-HPV foi detectado em 25,0 por cento das gestantes HIV-1 positivo com infecção cervical por HPV e 4,0 por cento das gestantes HIV-1 positivo sem infecção cervical por HPV (p=0,002). Nível de células CD4+ ≤ 200 células/mm3, presença de infecção cervical por HPV com alta carga viral (> 200 RLU) são preditivo de uma maior probabilidade de presença de DNA-HPV no sangue periférico. Estes dados evidenciam a presença do DNA-HPV no sangue periférico. A presença do genoma de HPV em sangue periférico ainda é controversa e deve ser melhor estudada para que possa ser relacionada com o desenvolvimento de lesões malignas.