O Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) tem extrema variabilidade genética resultante das altas taxas de mutação e recombinação, acarretados pela falta de atividade de revisão da transcriptase reversa,associado à alta taxa de replicação viral. [...] Estudos baseados na região do envelope viral detectam uma maior prevalência de subsubtipo F1 e menor de recombinantes BF1, já estudos com a região PR/RT encontram maior prevalência de BF1 e menor de F1. Assim, o presente estudo teve como objetivo reavaliar a caracterização molecular de um conjunto de amostras previamente classificadas como subsubtipo F1 apenas com a análise da região C2-V3 do envelope viral. Para tal, foram caracterizadas cinco regiões do genoma do HIV, incluindo as mais recombinogênicas, com a finalidade de estimar a prevalência real do subsubtipo F1, de realizar a dispersão temporal das amostras reclassificadas como subsubtipo F1 e recombinantes, e ainda compreender a complexidade dos perfis de recombinação. De um total de 635 amostras de HIV-1 positivas coletadas e previamente caracterizadas entre 1998-2013, 74 foram classificados como F1 na região C2-V3 env. Dessas, 56 possuíam amostras biológicas disponíveis e foram incluídas neste estudo. As amostras de DNA foram extraídas, amplificadas e sequenciadas nas regiões gag, PR / RT, INT, env e nef. As sequências foram alinhadas com amostras de referência do grupo M do HIV-1 pelo ClustalW...