En la actualidad, es creciente el interés por nuevas alternativas para reemplazar los antimicrobianos químicos debido a los efectos adversos para el consumidor. Existen especies botánicas con efecto antimicrobiano como los frutos de Capsicum que son de uso común en nuestro país. Los extractos obtenidos de los ajíes y pimientos poseen compuestos activos con efecto antimicrobiano sobre bacterias, hongos y virus; además, su uso es seguro debido a su naturaleza orgánica. Por ello, el objetivo del presente estudio fue evaluar la actividad bacteriostática y bactericida de extractos de Ají Panca (Capsicum chinense) y Pimiento (Capsicum annuum var. annuum) sobre Escherichia coli ATCC 25922 y Staphylococcus aureus ATCC 25923. Se elaboró extracto de ambos frutos con rendimientos de 12.53 ± 0.30% y 12.17 ± 0.23% para Ají Panca y Pimiento, respectivamente. Asimismo, el extracto de ají panca contuvo 1.39 mg de capsaicina y 0.54 mg de dihidrocapsaicina, determinadas por HPLC. Estos compuestos no se analizaron para el pimiento ya que los niveles son no detectables en variedades dulces. Se evaluó el efecto de ambos extractos a concentraciones de 25, 12.5, 6.25, 3.13, 1.56, 0.78, 0.39, 0.20, 0.10 y 0.04% usando el método de microdilución en caldo y posterior crecimiento en agares selectivos. Los resultados muestran que no existe efecto bacteriostático para ambas cepas. Asimismo, la viabilidad de E. coli ATCC 25922 no fue afectada por los dos extractos mientras que para S. aureus ATCC 25923 solo el ají panca no afecto su viabilidad. Finalmente, el efecto bactericida para S. aureus ATCC 25923, fue observado con el extracto de pimiento a concentraciones de 25, 12.5 y 6.25%.