A progressão e desenvolvimento de patologias pulpares e periapicais estão intimamente relacionados à presença de microrganismos e seus subprodutos nos sistema de canais radiculares (SCR), que induzem uma resposta de defesa adjacente ao ápice radicular. A angiogênese é apontada como fator essencial na patogênese das alterações periapicais crônicas, estando relacionada ao seu estabelecimento e manutenção, por ser fonte constante de citocinas, quimiocinas e proteases. A angiogênse também está relacionada ao reparo tecidual que segue à resolução das alterações perirradiculares após a realização da terapia endodôntica. Neste estudo, avaliou-se a expressão de fatores pró-angiogêncios e citocinas relacionadas, em amostras coletadas de pacientes (n=20) com dentes portadores de Periodontite Apical Crônica imediatamente após a instrumentação dos SCR e 7 dias após os procedimentos de desinfecção. As amostras foram analisadas por meio de reação em cadeia da polimerase em tempo real (PCR-RT). Verificou-se a expressão gênica de fatores pró-angiogênicos e citocinas Angiopoetina-1 (AGT1), Fator de crescimento endotelial vascular-A (VEGF-A), Fator de crescimento fibroblástico básico (FGF-β), Proteína quimiotática de monócitos (CCL2/MCP-1), Proteína inflamatória de macrófagos-1β (CCL4), C-X-C Receptor de quimiocina tipo 4 (CXCR4), C-C Receptor de quimiocina tipo 6 (CCR6), TNF-α, IFN-γ, IL-17, IL-10, IL6, RANK-L e MMP-9. A expressão do mRNA dos mediadores avaliados revelou aumento significativo nos níveis de AGT1, CCL2/MCP-1, CCL4, CCR6, TNF-α, IFN- γ, IL-10, RANK-L e MMP-9 no dia 7 quando comparado com o dia 0 (P <0,05). Para VEGF-A, FGF-β, CXCR4, IL-17 e IL-6 as expressões de mRNA foram semelhantes em ambos tempos mensurados (P> 0,05). Pode-se concluir que, após desinfecção do SCR, houve aumento nos níveis de expressão de mRNA de importantes mediadores envolvidos nos fenômenos angioproliferativos e osteogênicos.(AU)