Los pueblos indígenas en aislamiento y en contacto inicial (PIACI) son vulnerables al contagio de enfermedades externas, pues carecen de defensas inmunitarias. Esto genera interés por el desarrollo de políticas de protección de salud y otros determinantes. Objetivo. Describir las experiencias del “Intercambio técnico in locus sobre la metodología de protección de los pueblos indígenas aislados y contacto inicial en las regiones de Cusco y Madre de Dios”. Resultados. Los establecimientos de salud implementan normas y guías técnicas de protección de salud de los PIACI, las que se traducen en acciones preventivo-promocionales considerando el componente cultural; la protección de la salud a través de la inmunización, trabajos comunales como las estrategias de sensibilización orientados a la protección de la salud de los indígenas aislados, el registro de atenciones en la hoja HIS considerando la pertenencia étnica, la reserva de medicamentos e insumos para posibles contingencias; entre otros. Los PIACI identifican como enfermedades de alto riesgo a las infecciones respiratorias agudas y enfermedades diarreicas agudas, por el alto riesgo de morbimortalidad que tienen. Los gobiernos locales tienen limitaciones legales para ofrecer servicios de programas sociales pues los beneficiarios deben de contar con el Documento Nacional de Identidad (DNI). Conclusión. La implementación de la norma y guías técnicas de salud vigentes ofrecen atención diferenciada de salud; los diálogos e intercambio de experiencias de los países participantes en la misión técnica generan espacios de búsqueda de alternativas de solución frente a la necesidad de diseñar el plan regional de acción conjunta.