Estudo da Diversidade Genética e Mutações de Resistência do Hiv aos Arv S na Região Norte de Moçambique

Ano de publicação: 2013
Teses e dissertações em Português apresentado à Instituto Oswaldo Cruz para obtenção do título de Mestre. Orientador: Fernandez, josé carlos couto fernandez

O HIV é um retrovírus de evolução rápida caracterizado por uma enorme diversidade genética. Os eventos de recombinação durante a transcrição reversa, a elevada taxa de replicação viral e a incapacidade da transcriptase reversa em corrigir erros de incorporação de nucleotídeos nas cadeias em formação, são as maiores causas da grande diversidade genética do HIV. Esta diversidade confere ao vírus, flexibilidade na resposta á pressão de drogas e no surgimento de mutações de resistência aos ARVs. O conhecimento do perfil genético das estirpes virais que circulam numa determinada região é importante para a monitorização de algoritmos de testagem, desenho de candidatos vacinais e esquemas de tratamento anti-retroviral mais adequados á epidemia local. Há poucos estudos feitos sobre a diversidade genética do HIV na região Norte de Moçambique. Contudo, o elevado fluxo de imigrantes provenientes principalmente da África Central e a elevada diversidade genética do HIV nos países que fazem fronteira com Moçambique na região norte (Tanzania e Malawi), despertou o interesse no estudo da diversidade genética do HIV e consequentemente na circulação de mutações de resistência aos ARVs na região. Para tal, 120 amostras de plasma foram colhidas em dadores de sangue com serologia positiva ao HIV em 3 bancos de sangue da região Norte de Moçambique, entre Novembro de 2009 e Junho de 2010. O sequenciamento genético da região pol do genoma do HIV foi feito usando a metodologia Trugene HIV-1 Genotyping test e resultou em 95 (79.2%) sequências, das 120 amostras submetidas à análise. As análises filogenéticas feitas revelaram que das 95 sequências obtidas neste estudo, 75 (78.9%) isolados virais são do subtipo C do HIV-1, 15 (15.8%) isolados são de subtipos não C (A1, G e D), e cinco (5.3%) isolados são Únicas Formas Recombinantes (URFs). Em quatro amostras foram detectadas mutações de resistência aos NNRTIs (K103N, G190A e K101E). Estas são mutações principais e conferem alto nível de resistência a nevirapina e enfaverense. Foi detectado em uma amostra um perfil de mutações na região da protease (L10V, V11I, K20R, M36I, Q58E) que pode conferir resistência a SQV/r e TPV/r…
HIV is a retrovirus with high genetic diversity. This characteristic allows the virus to easily respond against the selective pressure of drugs, resulting in the appearance of drug resistance mutations. Recombination events during reverse transcription, high rate of viral replication and the lack of capacity of the RT to correct errors during reverse transcription are known as the major reasons of high genetic diversity of the HIV genome. Knowledge about the genetic diversity of circulating virus in a region can help understanding and implement better testing algorithm, design good vaccines and optimize therapeutic schedules according to the local epidemiology. There are few studies about HIV genetic diversity in North Mozambique. However, a high number of immigrants mainly from Central Africa and the high genetic diversity in neighborhood countries (Tanzania and Malawi) justify studies about genetic diversity and HIV resistance circulating in this region. For this purpose, 120 plasma samples were collected from HIV positive blood donors of three cities in North Mozambique, between November 2009 and June 2010. Sequencing of the HIV pol region was performed using Trugene HIV-1 Genotyping test methodology. From the 120 samples collected, 95 sequences were obtained. Filogenetic analysis of 95 available sequences, revealed that 75 (78.9%) isolates were C subtype, 10 A1 subtype, two G subtype and three D subtype. A total of five URFs were found in this study. In four samples were detected resistance mutation to NNRTIs (K103N, G190A and K101E). These were major mutations and cause resistance to Nevirapine and enfavirense. The mutations L10V, V11I, K20R, M36I, Q58E were also detected and may cause resistance to SQV/r and TPV/r…

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