A diarréia é uma importante causa de morbidade e mortalidade em todas as regiões do mundo e entre todas as idades, ainda pouco se sabe sobre a fracção de episódios de diarréia e óbitos de cada patógeno. Os rotavírus (RVs) foram designados como principal causa de doença diarréica e desihidratação grave em lactentes e crianças menores de 5 anos de idade. O rotavirus é oblíquo. O pico de incidência da doença ocorre no inverno nos países do climas temperado e durante todo nos países tropicais. Infecção RVA responsavel por causar 527.000 mortes por ano em todo o mundo. Na África RVs é responsável por 20% a 40% de todas as doenças diarreicas em crianças com menos de 60 meses de idade. Além disso, na África Subsaariana a mortalidade associada a RVA foi estimada em 145,000 mortes / ano. Em Moçambique não há dados que reportam os genótipos de rotavírus que ocorrem e sua contribuição na etiologia diarréia. O desenvolvimento de vacinas RVs tornou-se uma prioridade de saúde pública nos últimos anos, duas vacinas contra o rotavírus: Rotarix, (GSK, Rixensart, Bélgica) e pentavalente (Merck, NJ, EUA). Rotarix foi demonstrado ser eficaz na prevenção da doença grave causada por estirpes G1P[8], G3P[8], G4P[8], G9P[8] enquanto pentavalente na prevenção de doença causada por estirpes G1, G3, G4 e G9. Neste estudo propusemos a caracterizar as estirpes de RVA que ocorrem em população selecionada de crianças menores de cinco anos com diarréia aguda residente no distrito de Chókwè, Moçambique. A presença de rotavírus foi rastreada por EIA em 254 amostras, e 24% foram positivas rotavírus. A dsRNA foi extraído da suspensão fecal pelo metodo de sílica. A detecção de RVA foi realizada pela técnica de EPGA resultados obtidos estre os dois métodos demonstrou concordância em 75%. Todas as amostras apresentaram perfil eletroforético longo e compactáveis com rotavírus do grupo A, porém nenhuma infecção mista foi observada. A síntese de cDNA a partir do RNA extraído foi realizada utilizando-se o iniciador randômico contido no Kit High Capacity® (Applied Biosystems, USA), A PCR foi realizada com um pares de iniciadores consensuais para VP4 (4con2/4con3) e VP7 (9con1/9con2) onde os produtos da obtidos foram submetidos a PCR semi-nested multiplex usando iniciadores específicos para os genotipos G e P. As amostras que possiveies ser caracterizadas pelo PCR semi-nested foram submetidos a analise de sequencia. As combinações de genótipos predominantes foram RVA G12P [8] (51%); G1P [8] (19%); G12P [6] (6%). As informações produzidas neste estudo iram subsidiar a importância do monitoramento dos genótipos de rotavírus antes e durante a introdução da vacina contra o rotavírus e reforcara achados dos trabalhos dos países vizinhos da emergencia G12 na África para o qual ainda não existe vacina mostra proteção.